RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 DOCK10Q96BY6 2186 aa3.53□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 MEIOCA2RUB1 952 aa3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 A6NL46 340 aa3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 GJE1A6NN92 205 aa3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 RER1O15258 196 aa3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 CXCL13O43927 109 aa3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 UBL3O95164 117 aa3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 VAMP5O95183 116 aa3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 HLA-DQB1P01920 261 aa3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC2A1P11166 492 aa3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF17P17021 662 aa3.52□□□□□ -1.85
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LRRTM4-201ENST00000409088 HSD11B1P28845 292 aa3.52□□□□□ -1.85
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LRRTM4-201ENST00000409088 SELENOPP49908 381 aa3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 B3GALT5-AS1P59052 145 aa3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 RAC3P60763 192 aa3.52□□□□□ -1.85
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LRRTM4-201ENST00000409088 UBE2NLQ5JXB2 153 aa3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 PHYHD1Q5SRE7 291 aa3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 AGAP6Q5VW22 663 aa3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 CFAP77Q6ZQR2 320 aa3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 LINGO2Q7L985 606 aa3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 OR51D1Q8NGF3 324 aa3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 OR10S1Q8NGN2 331 aa3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 OR13C3Q8NGS6 347 aa3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 SYNPRQ8TBG9 265 aa3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 ROBO4Q8WZ75 1007 aa3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 NKD1Q969G9 470 aa3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 AGAP4Q96P64 663 aa3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 ABCG5Q9H222 651 aa3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 G6PC2Q9NQR9 355 aa3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 TAS2R4Q9NYW5 299 aa3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 CAMK2AQ9UQM7 478 aa3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 MED13Q9UHV7 2174 aa3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 DCDC2BA2VCK2 349 aa3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 PRSS47A8MTI9 375 aa3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 LMX1BO60663 402 aa3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 NEURL1O76050 574 aa3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 PTHLHP12272 177 aa3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 ART1P52961 327 aa3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
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LRRTM4-201ENST00000409088 SPOCK1Q08629 439 aa3.52□□□□□ -1.85
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LRRTM4-201ENST00000409088 HIST3H3Q16695 136 aa3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 BCL2L15Q5TBC7 163 aa3.52□□□□□ -1.85
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LRRTM4-201ENST00000409088 ASPHD2Q6ICH7 369 aa3.52□□□□□ -1.85
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LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
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LRRTM4-201ENST00000409088 LRRC18Q8N456 261 aa3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 TOMM5Q8N4H5 51 aa3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa3.52□□□□□ -1.85
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LRRTM4-201ENST00000409088 SLC25A38Q96DW6 304 aa3.52□□□□□ -1.85
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LRRTM4-201ENST00000409088 OR2M2Q96R28 347 aa3.52□□□□□ -1.85
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LRRTM4-201ENST00000409088 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 PCSK5Q92824 1860 aa3.52□□□□□ -1.85
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LRRTM4-201ENST00000409088 FTH1P19P0C7X4 201 aa3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 CALCBP10092 127 aa3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 GNALP38405 381 aa3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 MMP15P51511 669 aa3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 SRYQ05066 204 aa3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 PLA2G7Q13093 441 aa3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 PIP4P1Q86T03 277 aa3.52□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 GGNQ86UU5 652 aa3.52□□□□□ -1.85
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