RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404424.5

CLIP4-204, Transcript of CAP-Gly domain containing linker protein family member 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLIP4, Length 2,480 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4-204ENST00000404424 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa9.6□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 TMEM235A6NFC5 223 aa9.6□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 TRIM77I1YAP6 450 aa9.6□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 LGALS8O00214 317 aa9.6□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 WDPCPO95876 746 aa9.6□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 H2BFMP0C1H6 154 aa9.6□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 HLA-DOBP13765 273 aa9.6□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 ZNF28P17035 718 aa9.6□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 CTRB1P17538 263 aa9.6□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 GSK3AP49840 483 aa9.6□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 EFNA3P52797 238 aa9.6□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 CTRB2Q6GPI1 263 aa9.6□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 ZNF813Q6ZN06 617 aa9.6□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 Q6ZS52 159 aa9.6□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 SYT13Q7L8C5 426 aa9.6□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 LYG2Q86SG7 212 aa9.6□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 ZBTB44Q8NCP5 570 aa9.6□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 OR4D6Q8NGJ1 314 aa9.6□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 RNF133Q8WVZ7 376 aa9.6□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 UQCC2Q9BRT2 126 aa9.6□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 B3GNT4Q9C0J1 378 aa9.6□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 GPR160Q9UJ42 338 aa9.6□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 MYO9BQ13459 2157 aa9.6□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 ANKUB1A6NFN9 424 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 LMO7DNF2Z398 122 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 RAB27BO00194 218 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 BCL2L11O43521 198 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 BPNT1O95861 308 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 IL2RAP01589 272 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 ZBTB25P24278 435 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 GPR85P60893 370 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 CXADRP78310 365 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 ZNF273Q14593 569 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 CDNFQ49AH0 187 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 MOB3CQ70IA8 216 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 DTWD2Q8NBA8 298 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 PLPP5Q8NEB5 264 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 OR1L3Q8NH93 324 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 VN1R1Q9GZP7 353 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 VSIG4Q9Y279 399 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 KIF26BQ2KJY2 2108 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 UNC80Q8N2C7 3258 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 TBPP20226 339 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 LTBRP36941 435 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 STARP49675 285 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 C17orf67Q0P5P2 114 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 DEFB133Q30KQ1 61 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 OR10K2Q6IF99 312 aa9.59□□□□□ -0.87
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CLIP4-204ENST00000404424 CORO6Q6QEF8 472 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 KLHL24Q6TFL4 600 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 FJX1Q86VR8 437 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 D2HGDHQ8N465 521 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 SLC22A24Q8N4F4 322 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 ACBD4Q8NC06 268 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 SMRP1Q8NCR6 262 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 OR10K1Q8NGX5 313 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 MITD1Q8WV92 249 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 RLN3Q8WXF3 142 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 PHB2Q99623 299 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 CNTD2Q9H8S5 307 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa9.59□□□□□ -0.87
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CLIP4-204ENST00000404424 MKL2Q9ULH7 1088 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP4-204ENST00000404424 KNL1Q8NG31 2342 aa9.58□□□□□ -0.88
CLIP4-204ENST00000404424 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa9.58□□□□□ -0.88
CLIP4-204ENST00000404424 A0A1B0GX78 115 aa9.58□□□□□ -0.88
CLIP4-204ENST00000404424 P2RY10O00398 339 aa9.58□□□□□ -0.88
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CLIP4-204ENST00000404424 ZNF208O43345 1280 aa9.58□□□□□ -0.88
CLIP4-204ENST00000404424 FMODQ06828 376 aa9.58□□□□□ -0.88
CLIP4-204ENST00000404424 TAF13Q15543 124 aa9.58□□□□□ -0.88
CLIP4-204ENST00000404424 C3orf33Q6P1S2 294 aa9.58□□□□□ -0.88
CLIP4-204ENST00000404424 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa9.58□□□□□ -0.88
CLIP4-204ENST00000404424 CD163Q86VB7 1156 aa9.58□□□□□ -0.88
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CLIP4-204ENST00000404424 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
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CLIP4-204ENST00000404424 OR4S1Q8NGB4 309 aa9.58□□□□□ -0.88
CLIP4-204ENST00000404424 FGGYQ96C11 551 aa9.58□□□□□ -0.88
CLIP4-204ENST00000404424 DDIT4LQ96D03 193 aa9.58□□□□□ -0.88
CLIP4-204ENST00000404424 AIFM2Q9BRQ8 373 aa9.58□□□□□ -0.88
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