RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380701.7

CCDC171-201, Transcript of coiled-coil domain containing 171, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC171, Length 6,512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CCDC171-201ENST00000380701 OR1F12Q8NHA8 337 aa6.5□□□□□ -1.37
CCDC171-201ENST00000380701 RNF141Q8WVD5 230 aa6.5□□□□□ -1.37
CCDC171-201ENST00000380701 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
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CCDC171-201ENST00000380701 PLEKHA2Q9HB19 425 aa6.5□□□□□ -1.37
CCDC171-201ENST00000380701 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
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