RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 LINC01560Q8TB33 94 aa25.77■■□□□ 1.72
ECHS1-201ENST00000368547 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
ECHS1-201ENST00000368547 BABAM2Q9NXR7 383 aa25.77■■□□□ 1.72
ECHS1-201ENST00000368547 NDRG3Q9UGV2 375 aa25.77■■□□□ 1.72
ECHS1-201ENST00000368547 PHYHO14832 338 aa25.77■■□□□ 1.72
ECHS1-201ENST00000368547 TMCC2O75069 709 aa25.77■■□□□ 1.72
ECHS1-201ENST00000368547 WNT11O96014 354 aa25.77■■□□□ 1.72
ECHS1-201ENST00000368547 PCBD1P61457 104 aa25.77■■□□□ 1.72
ECHS1-201ENST00000368547 RAB1AP62820 205 aa25.77■■□□□ 1.72
ECHS1-201ENST00000368547 SSX1Q16384 188 aa25.77■■□□□ 1.72
ECHS1-201ENST00000368547 CTF1Q16619 201 aa25.77■■□□□ 1.72
ECHS1-201ENST00000368547 SLC18B1Q6NT16 456 aa25.77■■□□□ 1.72
ECHS1-201ENST00000368547 SYT9Q86SS6 491 aa25.77■■□□□ 1.72
ECHS1-201ENST00000368547 MDP1Q86V88 176 aa25.77■■□□□ 1.72
ECHS1-201ENST00000368547 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa25.77■■□□□ 1.72
ECHS1-201ENST00000368547 NDUFB11Q9NX14 153 aa25.77■■□□□ 1.72
ECHS1-201ENST00000368547 TUBAL3A6NHL2 446 aa25.76■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 HCCSP53701 268 aa25.76■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa25.76■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 WACQ9BTA9 647 aa25.76■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa25.76■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa25.76■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 COL12A1Q99715 3063 aa25.75■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 THBDP07204 575 aa25.75■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 ARR3P36575 388 aa25.75■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 GPR50Q13585 617 aa25.75■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM53Q6P2H8 277 aa25.75■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 PHC2Q8IXK0 858 aa25.75■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 UFD1Q92890 307 aa25.75■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 TRIM36Q9NQ86 728 aa25.75■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 COPS3Q9UNS2 423 aa25.75■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 LRRK2Q5S007 2527 aa25.75■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 PRR14LQ5THK1 2151 aa25.75■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 RER1O15258 196 aa25.74■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 TAS2R43P59537 309 aa25.74■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 PSG4Q00888 419 aa25.74■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 SCRN3Q0VDG4 424 aa25.74■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 CFAP77Q6ZQR2 320 aa25.74■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 SSX6Q7RTT6 188 aa25.74■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 DCXRQ7Z4W1 244 aa25.74■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa25.74■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 GJC3Q8NFK1 279 aa25.74■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 OTOSQ8NHW6 89 aa25.74■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 OR2H1Q9GZK4 316 aa25.74■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 PRSS44E7EML9 344 aa25.74■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 ALOX5APP20292 161 aa25.74■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa25.74■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 WFDC8Q8IUA0 241 aa25.74■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa25.74■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 SNX33Q8WV41 574 aa25.74■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 MAP6Q96JE9 813 aa25.74■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 C4orf36Q96KX1 117 aa25.74■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 PTTG2Q9NZH5 202 aa25.74■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 LAMP5Q9UJQ1 280 aa25.74■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 A1L4Q6 167 aa25.73■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 SLC22A1O15245 554 aa25.73■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 CLDN1O95832 211 aa25.73■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 HIST1H3AP68431 136 aa25.73■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 EGR3Q06889 387 aa25.73■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa25.73■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF684Q5T5D7 378 aa25.73■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa25.73■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa25.73■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 HIST2H3AQ71DI3 136 aa25.73■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 RFLNBQ8N5W9 214 aa25.73■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF454Q8N9F8 522 aa25.73■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 AKR7LQ8NHP1 331 aa25.73■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 WNT5BQ9H1J7 359 aa25.73■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 AIREO43918 545 aa25.72■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 LALBAP00709 142 aa25.72■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 CBR1P16152 277 aa25.72■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 IGFBP2P18065 325 aa25.72■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 GADD45AP24522 165 aa25.72■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 PEX19P40855 299 aa25.72■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 LIPKQ5VXJ0 399 aa25.72■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF774Q6NX45 483 aa25.72■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa25.72■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa25.72■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 SSX8Q7RTT4 187 aa25.72■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 KLBQ86Z14 1044 aa25.72■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 ST7LQ8TDW4 575 aa25.72■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 ASB17Q8WXJ9 295 aa25.72■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF75AQ96N20 296 aa25.72■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 C1orf198Q9H425 327 aa25.72■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 NPAP1Q9NZP6 1156 aa25.72■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa25.72■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 J3QLW9 94 aa25.71■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 SGCEO43556 437 aa25.71■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF19P17023 458 aa25.71■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 OR12D2P58182 307 aa25.71■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 THEM6Q8WUY1 208 aa25.71■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 ABHD6Q9BV23 337 aa25.71■■□□□ 1.71
ECHS1-201ENST00000368547 PLEK2Q9NYT0 353 aa25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms