RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF774Q6NX45 483 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 P2RY8Q86VZ1 359 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 PHC2Q8IXK0 858 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF676Q8N7Q3 588 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF485Q8NCK3 441 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 OR5AK2Q8NH90 309 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 OR1F12Q8NHA8 337 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 MUCL1Q96DR8 90 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 FUNDC2Q9BWH2 189 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 FAM192AQ9GZU8 254 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 MOB1AQ9H8S9 216 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 SLC17A5Q9NRA2 495 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 SSR3Q9UNL2 185 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 PRR32B1ATL7 298 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 E9PI62 339 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 M0R135 149 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 OGG1O15527 345 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 LRRTM2O43300 516 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 PLPP2O43688 288 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 GPRIN2O60269 458 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 ABHD16AO95870 558 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 LALBAP00709 142 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 SERPINA3P01011 423 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 COX5BP10606 129 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 GABRA5P31644 462 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 ASCL1P50553 236 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 TUBA1BP68363 451 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 CDK5R1Q15078 307 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 C4orf17Q53FE4 359 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 BCL2L15Q5TBC7 163 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 TUBA1AQ71U36 451 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 MS4A15Q8N5U1 240 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 OR10S1Q8NGN2 331 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 OR1J2Q8NGS2 313 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 FGFBP3Q8TAT2 258 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 SMIM19Q96E16 107 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 YIPF6Q96EC8 236 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF799Q96GE5 643 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 PGAM5Q96HS1 289 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 TMED9Q9BVK6 235 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 WNT5BQ9H1J7 359 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 NDUFB11Q9NX14 153 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 ATPIF1Q9UII2 106 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 OR52A1Q9UKL2 312 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 STUB1Q9UNE7 303 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 A0A1W2PR80 420 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 OR5H1A6NKK0 313 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM212A6NML5 194 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 FAM90A27PA6NNH2 459 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 H3BSA7 217 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 TBX1O43435 398 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 SYNGR3O43761 229 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 AIREO43918 545 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 HLA-DPB1P04440 258 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 CD53P19397 219 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 CCNOP22674 350 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 CCR9P51686 369 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 TMBIM6P55061 237 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 IGFBP7Q16270 282 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 SSX1Q16384 188 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 TBC1D28Q2M2D7 210 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 TIMM23BQ5SRD1 257 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 FDX2Q6P4F2 183 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 DRAM2Q6UX65 266 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 STAC2Q6ZMT1 411 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 MDP1Q86V88 176 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 COMMD2Q86X83 199 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 LIX1LQ8IVB5 337 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 OR2G2Q8NGZ5 317 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 RAB2BQ8WUD1 216 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM203Q969S6 136 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 CCDC120Q96HB5 630 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 BOD1Q96IK1 185 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 DOK1Q99704 481 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF224Q9NZL3 707 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 FRRS1LQ9P0K9 344 aa10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms