RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365430.1

RNU6-487P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 487, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-487P, Length 104 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-487P-201ENST00000365430 SMIM10L1P0DMW3 83 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 CD37P11049 281 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 ATF6P18850 670 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 RAB4AP20338 218 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 PPOXP50336 477 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 CDKN2DP55273 166 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 KRTAP12-2P59991 146 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 RPS23P62266 143 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 PAFAH1B2P68402 229 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 RAD51Q06609 339 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 GTF3C1Q12789 2109 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 CDH17Q12864 832 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC39A6Q13433 755 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 PRPSAP1Q14558 356 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 GINS1Q14691 196 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 STK11Q15831 433 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 KLHL40Q2TBA0 621 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 CT45A1Q5HYN5 189 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 SAXO2Q658L1 398 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 PRMT9Q6P2P2 845 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 TTC23LQ6PF05 361 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 ASCL4Q6XD76 172 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM92BQ6ZTR7 304 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 KRTAP5-2Q701N4 177 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 HDDC2Q7Z4H3 204 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 HORMAD1Q86X24 394 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 MICU2Q8IYU8 434 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF786Q8N393 782 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 RNF175Q8N4F7 328 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 KIF2BQ8N4N8 673 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 METTL13Q8N6R0 699 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF645Q8N7E2 425 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM184AQ8NB25 1140 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 OR10G2Q8NGC3 310 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 CT45A3Q8NHU0 189 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 TCP10LQ8TDR4 215 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 PIH1D2Q8WWB5 315 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 BAALCQ8WXS3 180 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 CACNG8Q8WXS5 425 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 RAB1CQ92928 201 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 TOP1MTQ969P6 601 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 ISOC2Q96AB3 205 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 NRBF2Q96F24 287 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 SMIM10Q96HG1 83 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 RGCCQ9H4X1 137 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 ASB8Q9H765 288 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 MYOZ2Q9NPC6 264 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 FBXO8Q9NRD0 319 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 CLN6Q9NWW5 311 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC39A1Q9NY26 324 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 ADAM22Q9P0K1 906 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC17A7Q9P2U7 560 aa1.65□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 LRP4O75096 1905 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP1.64□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM120BA0PK00 339 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 C5orf63A6NC05 138 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 NKX2-6A6NCS4 301 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 SERPINE3A8MV23 424 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 MPDU1O75352 247 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 MBP02144 154 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 CATP04040 527 aaKnown RBP1.64□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 PMCHP20382 165 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 IL32P24001 234 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 CD70P32970 193 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 GGT2P36268 569 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 GPR1P46091 355 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 CSNK1A1P48729 337 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 CCNG1P51959 295 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 ATP5J2P56134 94 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 CARD18P57730 90 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 RAP1AP62834 184 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 PRR3P79522 188 aaKnown RBP1.64□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 MECOMQ03112 1051 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF33AQ06730 810 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 CYP24A1Q07973 514 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 SYCNQ0VAF6 134 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 DEFB116Q30KQ4 102 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 C6orf183Q5T699 404 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 TSPO2Q5TGU0 170 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 UBE2UQ5VVX9 321 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 Q6P435 159 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 LINC00336Q6ZUF6 198 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 Q6ZVH6 145 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP1.64□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 LINC00523Q86TU6 105 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 PCP2Q8IVA1 136 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 ENTHD1Q8IYW4 607 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 PDCL2Q8N4E4 241 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 C15orf56Q8N910 161 aa1.64□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP1.64□□□□□ -2.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 CHST4Q8NCG5 386 aa1.64□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms