RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 IGFBP5P24593 272 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 GCH1P30793 250 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 MPV17P39210 176 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 MAGEB1P43366 347 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 HTR5AP47898 357 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 PPP1CBP62140 327 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 ESRRGP62508 458 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 CCL8P80075 99 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 SCRN3Q0VDG4 424 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 AQP6Q13520 282 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 MOGQ16653 247 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF718Q3SXZ3 478 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 SLC36A3Q495N2 470 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 SLC27A4Q6P1M0 643 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 ARL9Q6T311 187 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 PTCHD4Q6ZW05 846 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 GLB1L2Q8IW92 636 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 C1orf174Q8IYL3 243 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 LNX2Q8N448 690 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 SLC25A40Q8TBP6 338 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 RDH5Q92781 318 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 HPS1Q92902 700 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 YIPF5Q969M3 257 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 SLCO4A1Q96BD0 722 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 SAMD8Q96LT4 415 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 SOX7Q9BT81 388 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 BEX2Q9BXY8 128 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 OR2J1Q9GZK6 312 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 SHARPINQ9H0F6 387 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 ELOVL3Q9HB03 270 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 C8orf4Q9NR00 106 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 ASH2LQ9UBL3 628 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 KCNG2Q9UJ96 466 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 PPIHO43447 177 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 SGCEO43556 437 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 CDC14BO60729 498 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 RP2O75695 350 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 TGFAP01135 160 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 NGFP01138 241 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 COX5BP10606 129 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 HNF1AP20823 631 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 COL8A2P25067 703 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 GRK5P34947 590 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF81P51508 661 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 LSM6P62312 80 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM255AQ5JRV8 349 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 FAM120AOSQ5T036 256 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 OTPQ5XKR4 325 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 FAHD1Q6P587 224 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 LEG1Q6P5S2 330 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 IL17RELQ6ZVW7 336 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 NPEPL1Q8NDH3 523 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 OR2T4Q8NH00 348 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 SPATA3Q8NHX4 192 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 PYDC1Q8WXC3 89 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 ITPKCQ96DU7 683 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 PLEKHA8Q96JA3 519 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 C4orf45Q96LM5 186 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 C9orf16Q9BUW7 83 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 TSSK6Q9BXA6 273 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 NUAK2Q9H093 628 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 RACGAP1Q9H0H5 632 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 NARFLQ9H6Q4 476 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 SAP30LQ9HAJ7 183 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 KRT84Q9NSB2 600 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 DECR2Q9NUI1 292 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 VNN3Q9NY84 501 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 PLEK2Q9NYT0 353 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 POLR1DQ9Y2S0 133 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 DYSFO75923 2080 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 OR6C6A6NF89 314 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 DCTN6O00399 190 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 BHLHE40O14503 412 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 MPZL1O95297 269 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 GPANK1O95872 356 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 IGHV1-46P01743 117 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 TFP02787 698 aa6.52□□□□□ -1.37
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