RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 BAGE2Q86Y30 109 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 TMEFF1Q8IYR6 380 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 ARRDC1Q8N5I2 433 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 SLC37A2Q8TED4 501 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 PKMYT1Q99640 499 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 PRSS37A4D1T9 235 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 EDDM3BP56851 147 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 TANGO2Q6ICL3 276 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 DTX3Q8N9I9 347 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 SPPL3Q8TCT6 385 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 CALHM2Q9HA72 323 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 WNK2Q9Y3S1 2297 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 TAPBPO15533 448 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 Q6ZNB5 142 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 DBX2Q6ZNG2 339 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 CDH26Q8IXH8 852 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 LILRA2Q8N149 483 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 OR2G3Q8NGZ4 309 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 MZB1Q8WU39 189 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 H7C1C5 153 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 NRASP01111 189 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 IGLV3-25P01717 112 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 C1QBP02746 253 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 CXCL10P02778 98 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 OMGP23515 440 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 SSTR2P30874 369 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 GABRA4P48169 554 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 NPY4RP50391 375 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 CHST6Q9GZX3 395 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 FOXJ3Q9UPW0 622 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 NTNG1Q9Y2I2 539 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 CBR3O75828 277 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 LIMS3P0CW19 117 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 LIMS4P0CW20 117 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 UQCC3Q6UW78 93 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 SLC7A6Q92536 515 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 TMIGD2Q96BF3 282 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 ACTL7AQ9Y615 435 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 M0R135 149 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 ACOT8O14734 319 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 YY2O15391 372 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 FUT6P51993 359 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 ETFRF1Q6IPR1 90 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 TRNP1Q6NT89 227 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 CADM4Q8NFZ8 388 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF799Q96GE5 643 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 GSX2Q9BZM3 304 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 POMT2Q9UKY4 750 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 UMAD1C9J7I0 102 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 P2RY10O00398 339 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 MAOBP27338 520 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 ERHP84090 104 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 C18orf63Q68DL7 685 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 DLEU7Q6UYE1 221 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 SLAMF6Q96DU3 332 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 ALPK2Q86TB3 2170 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 M0R082 166 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 NME1P15531 152 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 RAB5AP20339 215 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 MMP11P24347 488 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 GJA5P36382 358 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 CLINT1Q14677 625 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 LAIR1Q6GTX8 287 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 ST7LQ8TDW4 575 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 GPR78Q96P69 363 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 SHARPINQ9H0F6 387 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 ACER3Q9NUN7 267 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 SLC23A1Q9UHI7 598 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 DVL1O14640 695 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 F10P00742 488 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 CLDN15P56746 228 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 PRAMEF20Q5VT98 475 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 BTNL8Q6UX41 500 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 OR2W3Q7Z3T1 314 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 PLPP7Q8NBV4 271 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 TAAR6Q96RI8 345 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 TEX101Q9BY14 249 aa5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms