RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340840.6

TRERF1-201, Transcript of transcriptional regulating factor 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRERF1, Length 4,174 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1-201ENST00000340840 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 TXNIPQ9H3M7 391 aa8.5□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 HRH4Q9H3N8 390 aa8.5□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 CSAG2Q9Y5P2 127 aa8.5□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 R4GMQ9 66 aa8.5□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 CDC14CA4D256 554 aa8.5□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 ZNF878C9JN71 531 aa8.5□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 DCTN6O00399 190 aa8.5□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 ITGB2P05107 769 aa8.5□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 GP1BAP07359 652 aa8.5□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 TBPP20226 339 aa8.5□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 MAOBP27338 520 aa8.5□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 MPGP29372 298 aa8.5□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 CASRP41180 1078 aa8.5□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 ATP1B3P54709 279 aa8.5□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 C2orf68Q2NKX9 166 aa8.5□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 COX15Q7KZN9 410 aa8.5□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 UBALD2Q8IYN6 164 aa8.5□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 OR13H1Q8NG92 308 aa8.5□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 OR4S1Q8NGB4 309 aa8.5□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 OIT3Q8WWZ8 545 aa8.5□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 MICU1Q9BPX6 476 aa8.5□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 RHPN2P1A8MT19 583 aa8.5□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 G3V3Q6 166 aa8.5□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 KIR3DL2P43630 455 aa8.5□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 C1orf140Q5VVS0 124 aa8.5□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 C5orf46Q6UWT4 87 aa8.5□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa8.5□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 OR1S2Q8NGQ3 325 aa8.5□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 OR13C9Q8NGT0 318 aa8.5□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa8.5□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 TMED6Q8WW62 240 aa8.5□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 MAP3K3Q99759 626 aa8.5□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 NUDT9Q9BW91 350 aa8.5□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 TNFSF18Q9UNG2 199 aa8.5□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 SLC25A4P12235 298 aa8.49□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 AVPR2P30518 371 aa8.49□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 SERPINF1P36955 418 aa8.49□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 PPIAP62937 165 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 TLE3Q04726 772 aa8.49□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 PPP1R1AQ13522 171 aa8.49□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 NSDHLQ15738 373 aa8.49□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 CD226Q15762 336 aa8.49□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 AVPI1Q5T686 147 aa8.49□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 DCXRQ7Z4W1 244 aa8.49□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 MARCH3Q86UD3 253 aa8.49□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 LINC00346Q8IVM7 164 aa8.49□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 OR10R2Q8NGX6 335 aa8.49□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 FAM60AQ9NP50 221 aa8.49□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 CYP8B1Q9UNU6 501 aa8.49□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 LRP12Q9Y561 859 aa8.49□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 TMEM218A2RU14 115 aa8.49□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 C4orf47A7E2U8 309 aa8.49□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 C1orf196B1AJZ1 125 aa8.49□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 CHRM2P08172 466 aa8.49□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 GPR3P46089 330 aa8.49□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 CX3CR1P49238 355 aa8.49□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 SLC9A3R2Q15599 337 aa8.49□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 MCHR2Q969V1 340 aa8.49□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 SDHAF3Q9NRP4 125 aa8.49□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 EDARQ9UNE0 448 aa8.49□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 MMACHCQ9Y4U1 282 aa8.49□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 ALOX12BO75342 701 aa8.49□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 ASAH2BP0C7U1 165 aa8.49□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 STK11Q15831 433 aa8.49□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 MDGA2Q7Z553 956 aa8.49□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 EXD3Q8N9H8 876 aa8.49□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 SERINC1Q9NRX5 453 aa8.49□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 FAM86C1Q9NVL1 165 aa8.49□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa8.49□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 GPR179Q6PRD1 2367 aa8.48□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa8.48□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 NPIPB9F8W1W9 429 aa8.48□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 ABHD16AO95870 558 aa8.48□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 PMP2P02689 132 aa8.48□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 PRH1P02810 166 aa8.48□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 HRH1P35367 487 aa8.48□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 FUT7Q11130 342 aa8.48□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 CHRFAM7AQ494W8 412 aa8.48□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 GKN2Q86XP6 184 aa8.48□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 PRSS35Q8N3Z0 413 aa8.48□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 OR10Z1Q8NGY1 313 aa8.48□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 ZDHHC12Q96GR4 267 aa8.48□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 C9orf170A2RU37 121 aa8.48□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 PRR32B1ATL7 298 aa8.48□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 ICOSLGO75144 302 aa8.48□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 APOC1P02654 83 aa8.48□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 CD1CP29017 333 aa8.48□□□□□ -1.05
TRERF1-201ENST00000340840 PPP1CAP62136 330 aa8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms