RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334414.10

PTPRB-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 12,316 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-202ENST00000334414 OR10D4PQ8NGN7 298 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 MZB1Q8WU39 189 aa5.06□□□□□ -1.6
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PTPRB-202ENST00000334414 FAM173AQ9BQD7 235 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 MARVELD1Q9BSK0 173 aa5.06□□□□□ -1.6
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PTPRB-202ENST00000334414 LHX3Q9UBR4 397 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRB-202ENST00000334414 WSB1Q9Y6I7 421 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
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PTPRB-202ENST00000334414 ZNF840PA6NDX5 716 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRB-202ENST00000334414 IKZF4Q9H2S9 585 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 IL17CQ9P0M4 197 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 GABRQQ9UN88 632 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 TNFSF12O43508 249 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 MT-ND6P03923 174 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 GYPBP06028 91 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 Q6ZVL8 140 aa5.05□□□□□ -1.6
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