RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307180.4

TSNARE1-201, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-201ENST00000307180 NAT2P11245 290 aa14.07□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 ADRA2CP18825 462 aa14.07□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 KIR3DL2P43630 455 aa14.07□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 RAP1BP61224 184 aa14.07□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 RAP1AP62834 184 aa14.07□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 RNFT1Q5M7Z0 435 aa14.07□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 UTS2BQ765I0 119 aa14.07□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 PRSS45Q7RTY3 260 aa14.07□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 LRRTM1Q86UE6 522 aa14.07□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 IZUMO1Q8IYV9 350 aa14.07□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 TOMM5Q8N4H5 51 aa14.07□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 OR10AC1Q8NH08 325 aa14.07□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 C4orf45Q96LM5 186 aa14.07□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 MRI1Q9BV20 369 aa14.07□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 LIN7BQ9HAP6 207 aa14.07□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 SDHAF3Q9NRP4 125 aa14.07□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa14.07□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM166BA8MTA8 275 aa14.07□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 CALCBP10092 127 aa14.07□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 BTCP35070 178 aa14.07□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 PTGDSP41222 190 aa14.07□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 OR3A3P47888 321 aa14.07□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 CLDN12P56749 244 aa14.07□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 ADAM8P78325 824 aa14.07□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 CD83Q01151 205 aa14.07□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 ROM1Q03395 351 aa14.07□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 TLE1Q04724 770 aa14.07□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 FOXF1Q12946 379 aa14.07□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 ODF4Q2M2E3 257 aa14.07□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 SIAH3Q8IW03 269 aa14.07□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 RNF128Q8TEB7 428 aa14.07□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 ANGPTL4Q9BY76 406 aa14.07□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 POTEKPQ9BYX7 375 aa14.07□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 HRH3Q9Y5N1 445 aa14.07□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 SHISA8B8ZZ34 492 aa14.06□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 NPIPA5E9PKD4 350 aa14.06□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 GPR171O14626 319 aa14.06□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 EFNA2O43921 213 aa14.06□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 TSPAN9O75954 239 aa14.06□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 IFNGR1P15260 489 aa14.06□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 CCR9P51686 369 aa14.06□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 RAB25P57735 213 aa14.06□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 GLO1Q04760 184 aa14.06□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 WDR38Q5JTN6 314 aa14.06□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 TEX30Q5JUR7 227 aa14.06□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 KRT77Q7Z794 578 aa14.06□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 ASB10Q8WXI3 467 aa14.06□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC25A38Q96DW6 304 aa14.06□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 ABHD6Q9BV23 337 aa14.06□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 BEX2Q9BXY8 128 aa14.06□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 TTTY12Q9BZ98 90 aa14.06□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 CHST11Q9NPF2 352 aa14.06□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 OR5V1Q9UGF6 321 aa14.06□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 NUP50Q9UKX7 468 aa14.06□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 NPIPA1Q9UND3 350 aa14.06□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa14.05□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa14.05□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 BET1O15155 118 aa14.05□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 MPZL1O95297 269 aa14.05□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 ARSBP15848 533 aa14.05□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 DAP3P51398 398 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 MAP2K6P52564 334 aa14.05□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 FOXO1Q12778 655 aa14.05□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 IGFBP7Q16270 282 aa14.05□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC25A53Q5H9E4 307 aa14.05□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF454Q8N9F8 522 aa14.05□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 OR51A4Q8NGJ6 313 aa14.05□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM106AQ96A25 262 aa14.05□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 MRGPRX4Q96LA9 322 aa14.05□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 GNRHR2Q96P88 292 aa14.05□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 DPAGT1Q9H3H5 408 aa14.05□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 C12orf4Q9NQ89 552 aa14.05□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 LIPT2A6NK58 231 aa14.05□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 H3BSH0 61 aa14.05□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa14.05□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 CRYABP02511 175 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 RFPL3SP0C7P2 107 aa14.05□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 PPIAP62937 165 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 HSF1Q00613 529 aa14.05□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 MTFR2Q6P444 385 aa14.05□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM122CQ6P4D5 195 aa14.05□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 SERPINA12Q8IW75 414 aa14.05□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 SMIM4Q8WVI0 70 aa14.05□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 RAB40AQ8WXH6 277 aa14.05□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 MCHR2Q969V1 340 aa14.05□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 RNF170Q96K19 258 aa14.05□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 WIF1Q9Y5W5 379 aa14.05□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 CACNA1CQ13936 2221 aa14.05□□□□□ -0.16
TSNARE1-201ENST00000307180 NPIPB13A6NJU9 1138 aa14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.9 ms