RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 GALP22466 123 aa18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 MMP16P51512 607 aa18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 CCR9P51686 369 aa18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 NCS1P62166 190 aa18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 DPPA2Q7Z7J5 298 aa18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 GABRG1Q8N1C3 465 aa18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 PRSS35Q8N3Z0 413 aa18.14■□□□□ 0.49
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PACSIN3-201ENST00000298838 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 RNF121Q9H920 327 aa18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 GALNT8Q9NY28 637 aa18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF224Q9NZL3 707 aa18.14■□□□□ 0.49
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PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM212A6NML5 194 aa18.13■□□□□ 0.49
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PACSIN3-201ENST00000298838 OPRM1P35372 400 aa18.13■□□□□ 0.49
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PACSIN3-201ENST00000298838 ECH1Q13011 328 aa18.13■□□□□ 0.49
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PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF774Q6NX45 483 aa18.13■□□□□ 0.49
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PACSIN3-201ENST00000298838 CATSPERDQ86XM0 798 aa18.13■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF610Q8N9Z0 462 aa18.13■□□□□ 0.49
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PACSIN3-201ENST00000298838 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 KCNJ15Q99712 375 aa18.13■□□□□ 0.49
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PACSIN3-201ENST00000298838 E9PLN8 166 aa18.12■□□□□ 0.49
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PACSIN3-201ENST00000298838 UBL3O95164 117 aa18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 SERPINA3P01011 423 aa18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 GALK2Q01415 458 aa18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 TBRG1Q3YBR2 411 aa18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 HIKESHIQ53FT3 197 aa18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 VKORC1Q9BQB6 163 aa18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF281Q9Y2X9 895 aa18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 CIB4A0PJX0 185 aa18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 TRIM64BA6NI03 449 aa18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 OR4C45A6NMZ5 311 aa18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 GABRPO00591 440 aa18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 SYNGR3O43761 229 aa18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 RAD51DO75771 328 aa18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 HLA-HP01893 362 aa18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 KIR3DL2P43630 455 aa18.12■□□□□ 0.49
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PACSIN3-201ENST00000298838 P2RY6Q15077 328 aa18.12■□□□□ 0.49
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PACSIN3-201ENST00000298838 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF676Q8N7Q3 588 aa18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 OR1F12Q8NHA8 337 aa18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 AKR7LQ8NHP1 331 aa18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 SPTSSAQ969W0 71 aa18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 MOB1AQ9H8S9 216 aa18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM206AQ9NX38 181 aa18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A0G2JNJ9 132 aa18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A1W2PPW3 197 aa18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 ARR3P36575 388 aa18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 CX3CR1P49238 355 aa18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 SPCS2Q15005 226 aa18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 BCL2L15Q5TBC7 163 aa18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 C22orf42Q6IC83 251 aa18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF283Q8N7M2 679 aa18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 IL17RDQ8NFM7 739 aa18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 KBTBD8Q8NFY9 601 aa18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 ABHD4Q8TB40 342 aa18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 WNT5BQ9H1J7 359 aa18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 BRD7Q9NPI1 651 aa18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 G6PC2Q9NQR9 355 aa18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 Q9UFV3 132 aa18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 OR52A1Q9UKL2 312 aa18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 OR6C6A6NF89 314 aa18.1■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 APOC1P02654 83 aa18.1■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 CD79AP11912 226 aa18.1■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 TGFBR1P36897 503 aa18.1■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 CA7P43166 264 aa18.1■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 HTR5AP47898 357 aa18.1■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 INSL4Q14641 139 aa18.1■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM211Q6ICI0 200 aa18.1■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM53Q6P2H8 277 aa18.1■□□□□ 0.49
PACSIN3-201ENST00000298838 USP43Q70EL4 1123 aa18.1■□□□□ 0.49
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