RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283875.5

GTF2E1-201, Transcript of general transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF2E1, Length 3,012 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1-201ENST00000283875 FAM3AP98173 230 aa6.65□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 SLC10A7Q0GE19 358 aa6.65□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa6.65□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 UBE2V1Q13404 147 aa6.65□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 PGGHGQ32M88 737 aa6.65□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 MARC1Q5VT66 337 aa6.65□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 NUP54Q7Z3B4 507 aa6.65□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 SYT9Q86SS6 491 aa6.65□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 WDFY1Q8IWB7 410 aa6.65□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 OR2M7Q8NG81 312 aa6.65□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 OR13C5Q8NGS8 318 aa6.65□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 OR13C2Q8NGS9 318 aa6.65□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 OR1P1Q8NH06 330 aa6.65□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 WFDC12Q8WWY7 111 aa6.65□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 SMPDL3AQ92484 453 aa6.65□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 IGSF21Q96ID5 467 aa6.65□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 WFDC6Q9BQY6 131 aa6.65□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.65□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 EBPLQ9BY08 206 aa6.65□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 OR51I1Q9H343 314 aa6.65□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 FOXJ2Q9P0K8 574 aa6.65□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 IKZF2Q9UKS7 526 aa6.65□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 CSAG2Q9Y5P2 127 aa6.65□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 NCOR1O75376 2440 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 PROB1E7EW31 1015 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 NPIPA2E9PIF3 369 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 SOCS6O14544 535 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 IFNA6P05013 189 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 HOXB2P14652 356 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 CCKARP32238 428 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 CAPZBP47756 277 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 GABRA4P48169 554 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 H3F3AP84243 136 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF85Q03923 595 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF385BQ569K4 471 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 PRSS54Q6PEW0 395 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 Q6ZRG5 221 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 GRINAQ7Z429 371 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 TAF8Q7Z7C8 310 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 TMEM229BQ8NBD8 167 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 OR6K2Q8NGY2 324 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 CASTOR1Q8WTX7 329 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 SUSD6Q92537 303 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 ZBTB8AQ96BR9 441 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 HMCESQ96FZ2 354 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 TMEM19Q96HH6 336 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 BOCQ9BWV1 1114 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 LUZP4Q9P127 313 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 STEAP1Q9UHE8 339 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 DYRK1BQ9Y463 629 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 A0A1W2PRU2 124 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 DRGXA6NNA5 263 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 HHLA1C9JL84 531 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 GRM6O15303 877 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 PIN1P1O15428 100 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 DOK2O60496 412 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 PRAMEF4O60810 478 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 GPR37L1O60883 481 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 OR2J2O76002 312 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 EOMESO95936 686 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 PIRTP0C851 137 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 PGA3P0DJD8 388 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 ALPPL2P10696 532 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 FGF5P12034 268 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 PTHLHP12272 177 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 SRMP19623 302 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 CYCSP99999 105 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 PTSQ03393 145 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 CDK5R1Q15078 307 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 MORN2Q502X0 79 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 STEAP1BQ6NZ63 245 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 ANKRD16Q6P6B7 361 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 VHLLQ6RSH7 139 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 MED25Q71SY5 747 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 GABRG1Q8N1C3 465 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 C11orf42Q8N5U0 333 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 STT3BQ8TCJ2 826 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 PPP1R16AQ96I34 528 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 PRRC1Q96M27 445 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 PRRT1Q99946 306 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 ADAP2Q9NPF8 381 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 VPS29Q9UBQ0 182 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 SRPK3Q9UPE1 567 aa6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms