RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229307.8

NANOG-201, Transcript of Nanog homeobox, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NANOG, Length 5,183 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOG-201ENST00000229307 LIN7BQ9HAP6 207 aa7.17□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 GPR173Q9NS66 373 aa7.17□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 UFSP2Q9NUQ7 469 aa7.17□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 PATJQ8NI35 1801 aa7.17□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 PROB1E7EW31 1015 aa7.17□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 TERTO14746 1132 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 TO15178 435 aa7.17□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 NDUFB3O43676 98 aa7.17□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 C1QAP02745 245 aa7.17□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 FUCA1P04066 466 aa7.17□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 CHRM2P08172 466 aa7.17□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 H2AFB2P0C5Z0 115 aa7.17□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 MPGP29372 298 aa7.17□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 F2RL1P55085 397 aa7.17□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 TAS2R19P59542 299 aa7.17□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 FGL1Q08830 312 aa7.17□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 ANKRD34AQ69YU3 496 aa7.17□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 GSG1LQ6UXU4 331 aa7.17□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 FAM185AQ8N0U4 392 aa7.17□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 OR4D6Q8NGJ1 314 aa7.17□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 OR51E1Q8TCB6 317 aa7.17□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 ATG2BQ96BY7 2078 aa7.17□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 TMEM129A0AVI4 362 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 ANKRD61A6NGH8 418 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 CD300LBA8K4G0 201 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 E9PI62 339 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 APOA2P02652 100 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 SCG5P05408 212 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 CTXN2P0C2S0 81 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 PPP3CBP16298 524 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 CD53P19397 219 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 LIPAP38571 399 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 SMUG1Q53HV7 270 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 OR2G6Q5TZ20 316 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 OR1M1Q8NGA1 313 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 PBOV1Q9GZY1 135 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 IKZF5Q9H5V7 419 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 ZAR1LA6NP61 321 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 PLPP3O14495 311 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 SLC2A1P11166 492 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 AKR1C4P17516 323 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 SRP14P37108 136 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 ETV5P41161 510 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 PMPCAQ10713 525 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 EDDM3AQ14507 147 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 SLC17A1Q14916 467 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 LIPNQ5VXI9 398 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 ACOD1A6NK06 481 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 LIPT2A6NK58 231 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 AQP7P3A6NL99 342 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 LYZL6O75951 148 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 HNF1AP20823 631 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 FUT6P51993 359 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 CYCSP99999 105 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 HES1Q14469 280 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 FJX1Q86VR8 437 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 TMEM151AQ8N4L1 468 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 WNT2BQ93097 391 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 ELMOD3Q96FG2 381 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 ABCG5Q9H222 651 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 UBTD1Q9HAC8 227 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 A4GNTQ9UNA3 340 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 PCP4L1A6NKN8 68 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 ARPC3O15145 178 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 CRYBA1P05813 215 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 THBS4P35443 961 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 ECI1P42126 302 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 VEGFCP49767 419 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 P2RY6Q15077 328 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 CORO6Q6QEF8 472 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 PLXDC2Q6UX71 529 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 ACBD4Q8NC06 268 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 GALNT11Q8NCW6 608 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 OR51F2Q8NH61 342 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 OR1S1Q8NH92 325 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 UPRTQ96BW1 309 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 PHB2Q99623 299 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 NRTNQ99748 197 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 GPR84Q9NQS5 396 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 NTMQ9P121 344 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 IL17BQ9UHF5 180 aa7.16□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 H7C2Y5 167 aa7.15□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 SPRY3O43610 288 aa7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms