RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222753.5

HOXA13-201, Transcript of homeobox A13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA13, Length 5,030 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13-201ENST00000222753 MARCH1Q8TCQ1 289 aa16.89■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 OR1E3Q8WZA6 343 aa16.89■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 C12orf10Q9HB07 376 aa16.89■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 RHOFQ9HBH0 211 aa16.89■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF749O43361 778 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 HNF4GQ14541 408 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 NXPE3Q969Y0 559 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 TBC1D29Q9UFV1 150 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 GLI3P10071 1580 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 NPIPB8E9PQR5 432 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 TMEM71Q6P5X7 295 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 ZDHHC22Q8N966 263 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 OR5M8Q8NGP6 311 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 STMND1H3BQB6 276 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 CLDN1O95832 211 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 CPN1P15169 458 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 TMEM128Q5BJH2 165 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 SPPL3Q8TCT6 385 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 PELI1Q96FA3 418 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 MAP3K3Q99759 626 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 TXNIPQ9H3M7 391 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 KCNIP2Q9NS61 270 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 MYOTQ9UBF9 498 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 OR14J1Q9UGF5 321 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 CHRNA9Q9UGM1 479 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 RNF150Q9ULK6 438 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 H7C1Q1 480 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 CTXN2P0C2S0 81 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 EPHA4P54764 986 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 OR2B8PP59922 312 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 HSF1Q00613 529 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF626Q68DY1 528 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 TEX19Q8NA77 164 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 CHST11Q9NPF2 352 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 PCDHB10Q9UN67 800 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 SLC22A13Q9Y226 551 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 PIGLQ9Y2B2 252 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 CCL27Q9Y4X3 112 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 ZFP92A6NM28 416 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF587BE7ETH6 402 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 PTAFRP25105 342 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 C9orf62Q8N4C0 152 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 RLN3Q8WXF3 142 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 ABHD1Q96SE0 405 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 H7BYZ3 331 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 THBS3P49746 956 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 SLC25A30Q5SVS4 291 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 MAMSTRQ6ZN01 415 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 SUMF1Q8NBK3 374 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 ANKRD16Q6P6B7 361 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 KIRREL2Q6UWL6 708 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 ORAI1Q96D31 301 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 MIXL1Q9H2W2 232 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 GHRLQ9UBU3 117 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 SLC23A2Q9UGH3 650 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 CTDSPLO15194 276 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 SLC25A1P53007 311 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 PLXDC2Q6UX71 529 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 OR51E1Q8TCB6 317 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 KCNG2Q9UJ96 466 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 ACAD8Q9UKU7 415 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 PAPPAQ13219 1627 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 PRAMEF4O60810 478 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 B3GALNT1O75752 331 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 GCH1P30793 250 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 BAXQ07812 192 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 FXNQ16595 210 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF425Q6IV72 752 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 RNF32Q9H0A6 362 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 ARGFXA6NJG6 315 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 FOXK1P85037 733 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 ARPC3O15145 178 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 F10P00742 488 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 OR2W3Q7Z3T1 314 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 CA13Q8N1Q1 262 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 MMP26Q9NRE1 261 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 PLA2G10O15496 165 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 SLC2A1P11166 492 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 CD1CP29017 333 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXA13-201ENST00000222753 CXCL12P48061 93 aa16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms