RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 ELK1P19419 428 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 ABCD3P28288 659 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 ELLP55199 621 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 Q56UQ5 140 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 STUMQ69YW2 141 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 OR2M2Q96R28 347 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 TMEM38AQ9H6F2 299 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 CITO14578 2027 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 M0QYG6 137 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 CHEK1O14757 476 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 FADS1O60427 444 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 SOD1P00441 154 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 IL9P15248 144 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 SHC1P29353 583 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 RPS10P46783 165 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 MTNR1BP49286 362 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 FZD2Q14332 565 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 SPATA46Q5T0L3 261 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 SFXN4Q6P4A7 337 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 CORO6Q6QEF8 472 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 C20orf85Q9H1P6 137 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF391Q9UJN7 358 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 TFF2Q03403 129 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 CEACAM16Q2WEN9 425 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 PLK5Q496M5 336 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 OLIG3Q7RTU3 272 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 GALNT16Q8N428 558 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 CCL17Q92583 94 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 SOX7Q9BT81 388 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 SMOC1Q9H4F8 434 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 KCNG2Q9UJ96 466 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 GABRA1P14867 456 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 TRIM23P36406 574 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 RPS25P62851 125 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 TIGITQ495A1 244 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 OR2L13Q8N349 312 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 TAAR6Q96RI8 345 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 LYSMD1Q96S90 227 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 PRR14Q9BWN1 585 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 A0A0B4J203 849 aa9.59□□□□□ -0.87
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TRPS1-201ENST00000220888 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 SDHAP31040 664 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 ARRB2P32121 409 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 LYPD4Q6UWN0 246 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 TERB2Q8NHR7 220 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF835Q9Y2P0 537 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 LRP6O75581 1613 aa9.59□□□□□ -0.87
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TRPS1-201ENST00000220888 AGBL4Q5VU57 503 aa9.59□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 SFTPA2Q8IWL1 248 aa9.59□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 SFTPA1Q8IWL2 248 aa9.59□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 SLC15A4Q8N697 577 aa9.59□□□□□ -0.88
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TRPS1-201ENST00000220888 ARPC5LQ9BPX5 153 aa9.59□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 GPR84Q9NQS5 396 aa9.59□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 MED29Q9NX70 200 aa9.59□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 MEIOCA2RUB1 952 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 LRRC3CA6NJW4 275 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF85Q03923 595 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 ENTHD1Q8IYW4 607 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 SLC38A9Q8NBW4 561 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 OR8U1Q8NH10 309 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 OR5B3Q8NH48 314 aa9.58□□□□□ -0.88
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TRPS1-201ENST00000220888 CNR1P21554 472 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 NME2P22392 152 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 FOXF1Q12946 379 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 PCK2Q16822 640 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 PHYHD1Q5SRE7 291 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 TAS2R16Q9NYV7 291 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 LAMP3Q9UQV4 416 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 TAPBPO15533 448 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 OR7C2O60412 319 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 CEACAM5P06731 702 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 FBP1P09467 338 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 RAB1AP62820 205 aa9.58□□□□□ -0.88
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