RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000200652.3

SLC22A4-201, Transcript of solute carrier family 22 member 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC22A4, Length 2,201 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A4-201ENST00000200652 QDPRP09417 244 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 CSF1P09603 554 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 LIFP15018 202 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 SLC25A25Q6KCM7 469 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 LUZP2Q86TE4 346 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 OR4C16Q8NGL9 310 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 POLR1DQ9Y2S0 133 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 A0A1B0GVI7 797 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 ZNF726A6NNF4 738 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 G3V3Y1 287 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 PMS2P2O95744 297 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 GABRA1P14867 456 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 FAUP35544 74 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 MLF1P58340 268 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 TMEM156Q8N614 296 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 NKAIN3Q8N8D7 197 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 OR11H4Q8NGC9 324 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 GRPEL2Q8TAA5 225 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 SEC22CQ9BRL7 303 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 MGAT4AQ9UM21 535 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 MEIS3P1A6NDR6 274 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 SYT7O43581 403 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 ZIC3O60481 467 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 MECP2P51608 486 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 H3F3AP84243 136 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 OR4D10Q8NGI6 311 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 GPX8Q8TED1 209 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 DLL4Q9NR61 685 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 NPTNQ9Y639 398 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 TECTAO75443 2155 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 B4E171 279 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 ZNF878C9JN71 531 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 GP1BAP07359 652 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 ACP1P24666 158 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 TSPAN7P41732 249 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 CLDN17P56750 224 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 ANGPT1Q15389 498 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 KCNMB1Q16558 191 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 ZNF813Q6ZN06 617 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 OR4D6Q8NGJ1 314 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 GAL3ST1Q99999 423 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 CFAP54Q96N23 3096 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 GTF2F2P13984 249 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 BDKRB2P30411 391 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 SELENOPP49908 381 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 GABREP78334 506 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 RAET1LQ5VY80 246 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 OR10K2Q6IF99 312 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 CREB3L2Q70SY1 520 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 ZNF627Q7L945 461 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 OR1J2Q8NGS2 313 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 MED30Q96HR3 178 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 SORCS2Q96PQ0 1159 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 HPF1Q9NWY4 346 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 PTTG3PQ9NZH4 202 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 ASH2LQ9UBL3 628 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 A0A1B0GTI1 187 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 OR2M5A3KFT3 312 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 HSD11B1P28845 292 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 GNALP38405 381 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 CLDN6P56747 220 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 TCEAL6Q6IPX3 200 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 RHOUQ7L0Q8 258 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 TCEAL3Q969E4 200 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 SEH1LQ96EE3 360 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 FRYLO94915 3013 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 RER1O15258 196 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 IL5P05113 134 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 AKAIN1P0CW23 69 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 PRKXP51817 358 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 TAF13Q15543 124 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 ARMC10Q8N2F6 343 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 CLEC1AQ8NC01 280 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 OR1M1Q8NGA1 313 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 PTX4Q96A99 478 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 CNTD2Q9H8S5 307 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC22A4-201ENST00000200652 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms