RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000182527.3

TRAM2-201, Transcript of translocation associated membrane protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAM2, Length 6,908 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-201ENST00000182527 PBDC1Q9BVG4 233 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAM2-201ENST00000182527 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
TRAM2-201ENST00000182527 PLAC1Q9HBJ0 212 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAM2-201ENST00000182527 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
TRAM2-201ENST00000182527 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAM2-201ENST00000182527 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAM2-201ENST00000182527 SERPINE2P07093 398 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAM2-201ENST00000182527 FBXO45P0C2W1 286 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAM2-201ENST00000182527 FADDQ13158 208 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAM2-201ENST00000182527 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAM2-201ENST00000182527 TRABD2AQ86V40 505 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAM2-201ENST00000182527 CDC20BQ86Y33 519 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAM2-201ENST00000182527 SKA3Q8IX90 412 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAM2-201ENST00000182527 OR8H3Q8N146 312 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAM2-201ENST00000182527 OR13A1Q8NGR1 328 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAM2-201ENST00000182527 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
TRAM2-201ENST00000182527 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
TRAM2-201ENST00000182527 SNTG1Q9NSN8 517 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAM2-201ENST00000182527 FETUBQ9UGM5 382 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAM2-201ENST00000182527 CELA3BP08861 270 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAM2-201ENST00000182527 FUT1P19526 365 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAM2-201ENST00000182527 ERP29P30040 261 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
TRAM2-201ENST00000182527 GPX6P59796 221 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAM2-201ENST00000182527 MAP4K2Q12851 820 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAM2-201ENST00000182527 MSMO1Q15800 293 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAM2-201ENST00000182527 CMC1Q7Z7K0 106 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAM2-201ENST00000182527 HMGN2P46Q86SG4 172 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAM2-201ENST00000182527 LILRB4Q8NHJ6 448 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAM2-201ENST00000182527 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
TRAM2-201ENST00000182527 LYSMD1Q96S90 227 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAM2-201ENST00000182527 AGAP20933 346 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAM2-201ENST00000182527 NDUFA6P56556 154 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAM2-201ENST00000182527 SLC25A3Q00325 362 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAM2-201ENST00000182527 HSD17B12Q53GQ0 312 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAM2-201ENST00000182527 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
TRAM2-201ENST00000182527 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
TRAM2-201ENST00000182527 PLSCR3Q9NRY6 295 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAM2-201ENST00000182527 RNF7Q9UBF6 113 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAM2-201ENST00000182527 MEIKINA0A087WXM9 373 aa6.65□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 NDUFA2O43678 99 aa6.65□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 GGNBP1Q5YKI7 109 aa6.65□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 STUMQ69YW2 141 aa6.65□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 SDR9C7Q8NEX9 313 aa6.65□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 OR5M8Q8NGP6 311 aa6.65□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 CCDC32Q9BV29 185 aa6.65□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 RAB33BQ9H082 229 aa6.65□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 ZNF69Q9UC07 566 aa6.65□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 THADAQ6YHU6 1953 aa6.65□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 MOSPD3O75425 235 aa6.65□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 MBP02144 154 aa6.65□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 MTCP1P56278 107 aa6.65□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 HACD4Q5VWC8 232 aa6.65□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 FCAMRQ8WWV6 532 aa6.65□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 MALSU1Q96EH3 234 aa6.65□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 SORCS2Q96PQ0 1159 aa6.65□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 TSSK6Q9BXA6 273 aa6.65□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 MMP27Q9H306 513 aa6.65□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 NT5DC2Q9H857 520 aa6.65□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 SERTAD4Q9NUC0 356 aa6.65□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 CEPT1Q9Y6K0 416 aa6.65□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 CYR61O00622 381 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 COMMD6Q7Z4G1 85 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 ZNF596Q8TC21 504 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 KIRREL1Q96J84 757 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 APC2O95996 2303 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 SEC14L6B5MCN3 397 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 SLC16A7O60669 478 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 RBP4P02753 201 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 THBDP07204 575 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 PJVKQ0ZLH3 352 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 TESK1Q15569 626 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 RNFT1Q5M7Z0 435 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 ZNF546Q86UE3 836 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 SLC25A42Q86VD7 318 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 RFLNBQ8N5W9 214 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 OR2T33Q8NG76 320 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 OR5D14Q8NGL3 314 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 TOR3AQ9H497 397 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 PCTPQ9UKL6 214 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 NID1P14543 1247 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 TFPI2P48307 235 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 FZD5Q13467 585 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 UBE2NLQ5JXB2 153 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 PCSK4Q6UW60 755 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 RANBP10Q6VN20 620 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 GRPEL2Q8TAA5 225 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 FBLIM1Q8WUP2 373 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 SLCO4A1Q96BD0 722 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 SLC41A3Q96GZ6 507 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
TRAM2-201ENST00000182527 TTTY10Q9BZA0 68 aa6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms