RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	WWOX	Q9NZC7	414 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	SCML1	Q9UN30	329 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	PDE10A	Q9Y233	779 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	SYCE1L	A8MT33	242 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	FBP2	O00757	339 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	SNAP91	O60641	907 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	PDE5A	O76074	875 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	BCKDHA	P12694	445 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	GFAP	P14136	432 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	LIF	P15018	202 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	BCKDHB	P21953	392 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	SOX3	P41225	446 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	HAAO	P46952	286 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	NUDT2	P50583	147 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	XG	P55808	180 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	RHOA	P61586	193 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	AP1S1	P61966	158 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	SKP1	P63208	163 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	LCN2	P80188	198 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	RAB40B	Q12829	278 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	PON2	Q15165	354 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	RAB35	Q15286	201 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	TIGIT	Q495A1	244 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	EOGT	Q5NDL2	527 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	C22orf42	Q6IC83	251 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	PIM3	Q86V86	326 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	STK40	Q8N2I9	435 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	TBRG4	Q969Z0	631 aa	Known RBP eCLIP	4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	CHID1	Q9BWS9	393 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	DERL2	Q9GZP9	239 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	VCX3B	Q9H321	246 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	GALP	Q9UBC7	116 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	TMCO1	Q9UM00	188 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	POMP	Q9Y244	141 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	OARD1	Q9Y530	152 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	TECTA	O75443	2155 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	RAB19	A4D1S5	217 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF724	A8MTY0	619 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616		E5RI56	91 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	NPIPA5	E9PKD4	350 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	AZIN1	O14977	448 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	SUPT3H	O75486	399 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	FCN3	O75636	299 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	PRSS56	P0CW18	603 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	CDK4	P11802	303 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	ME2	P23368	584 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	ATP5A1	P25705	553 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	IL12B	P29460	328 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	HMGCL	P35914	325 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	CRAT	P43155	626 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	NPBWR2	P48146	333 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	RFX3	P48380	749 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	ERF	P50548	548 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	ATP4B	P51164	291 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF85	Q03923	595 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	BCL2L1	Q07817	233 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	RBBP4	Q09028	425 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	TRAF2	Q12933	501 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	SNTA1	Q13424	505 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	P2RY6	Q15077	328 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	OR4D1	Q15615	310 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	CARD16	Q5EG05	197 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		4.17	□□□□□ -1.74

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