RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 CPT2P23786 658 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 ERFP50548 548 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC18A1P54219 525 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 FGF12P61328 243 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 GUCY1A3Q02108 690 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM205BPQ63HN1 556 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 HAVCR1Q96D42 359 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 CHIAQ9BZP6 476 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 RIMS3Q9UJD0 308 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 PIP5K1CO60331 668 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 NDUFA7O95182 113 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 OR5F1O95221 314 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 COX5BP10606 129 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 PITPNBP48739 271 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 CTXN1P60606 82 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 RELBQ01201 579 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 SCRN3Q0VDG4 424 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 SYT9Q86SS6 491 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 C1QL4Q86Z23 238 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 MEGF10Q96KG7 1140 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 COG8Q96MW5 612 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM246Q9BRR3 403 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 NOX4Q9NPH5 578 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 POLE4Q9NR33 117 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 ANGPT2O15123 496 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 SGCEO43556 437 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 IGF2P01344 180 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 TSPAN19P0C672 248 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 NFYCQ13952 458 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 RHOUQ7L0Q8 258 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 OR10A6Q8NH74 314 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 LIPHQ8WWY8 451 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 PTP4A1Q93096 173 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 C7orf26Q96N11 449 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 CLN8Q9UBY8 286 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 HIF3AQ9Y2N7 669 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 NDUFAF1Q9Y375 327 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 A6NIZ1 184 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC30A6NM36 301 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 H7C1C5 153 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 SRP9P49458 86 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 RAP1BP61224 184 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 LCN6P62502 163 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 RAP1AP62834 184 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 PDCD1Q15116 288 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 Q6YL49 198 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 MOGAT3Q86VF5 341 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 PCGF1Q9BSM1 259 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 PRDM13Q9H4Q3 707 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 PTTG3PQ9NZH4 202 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 KIF17Q9P2E2 1029 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 SCG5P05408 212 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 IFI30P13284 250 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 MICU2Q8IYU8 434 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 RABEP2Q9H5N1 569 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 BAG5Q9UL15 447 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF114Q9Y508 228 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 MELTFP08582 738 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 RAC2P15153 192 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 VMACQ2NL98 169 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM201AQ5SY85 155 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 OR2T2Q6IF00 324 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 C1orf87Q8N0U7 546 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM86BQ8N661 226 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 FITM2Q8N6M3 262 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC7A6Q92536 515 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 CDADC1Q9BWV3 514 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 CRYBA2P53672 197 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 BPIFB3P59826 476 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP10-3P60369 221 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF404Q494X3 552 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 ASPHD2Q6ICH7 369 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 DPP10Q8N608 796 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 OR13G1Q8NGZ3 307 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 OR51A7Q8NH64 312 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC8CQ8TDW0 803 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 BPIFA2Q96DR5 249 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 WACQ9BTA9 647 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 WNK1Q9H4A3 2382 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAV27A0A087WT01 109 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 IRF2P14316 349 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 SELEP16581 610 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 OR1E2P47887 323 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 TAF9Q16594 264 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF620Q6ZNG0 422 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC80Q76M96 950 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-217ENST00000629983 OR8G5Q8NG78 346 aa22.8■■□□□ 1.24
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