RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 GLCEO94923 617 aa21.01■□□□□ 0.95
CAPNS1-216ENST00000628306 VAMP5O95183 116 aa21.01■□□□□ 0.95
CAPNS1-216ENST00000628306 SBK2P0C263 348 aa21.01■□□□□ 0.95
CAPNS1-216ENST00000628306 SPI1P17947 270 aa21.01■□□□□ 0.95
CAPNS1-216ENST00000628306 AHCYP23526 432 aa21.01■□□□□ 0.95
CAPNS1-216ENST00000628306 PSMB9P28065 219 aa21.01■□□□□ 0.95
CAPNS1-216ENST00000628306 P2RY4P51582 365 aa21.01■□□□□ 0.95
CAPNS1-216ENST00000628306 BLVRAP53004 296 aa21.01■□□□□ 0.95
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CAPNS1-216ENST00000628306 ACTA1P68133 377 aa21.01■□□□□ 0.95
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CAPNS1-216ENST00000628306 LEG1Q6P5S2 330 aa21.01■□□□□ 0.95
CAPNS1-216ENST00000628306 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
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CAPNS1-216ENST00000628306 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
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CAPNS1-216ENST00000628306 HDDC2Q7Z4H3 204 aa21■□□□□ 0.95
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
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CAPNS1-216ENST00000628306 PRSS37A4D1T9 235 aa20.99■□□□□ 0.95
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CAPNS1-216ENST00000628306 C11orf98E9PRG8 122 aa20.98■□□□□ 0.95
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CAPNS1-216ENST00000628306 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
CAPNS1-216ENST00000628306 LINC01590Q5TEZ4 76 aa20.98■□□□□ 0.95
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CAPNS1-216ENST00000628306 OR5M11Q96RB7 305 aa20.98■□□□□ 0.95
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CAPNS1-216ENST00000628306 ENPP5Q9UJA9 477 aa20.98■□□□□ 0.95
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CAPNS1-216ENST00000628306 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa20.97■□□□□ 0.95
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC35D2Q76EJ3 337 aa20.97■□□□□ 0.95
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CAPNS1-216ENST00000628306 KLHL36Q8N4N3 616 aa20.97■□□□□ 0.95
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM99Q8N816 258 aa20.97■□□□□ 0.95
CAPNS1-216ENST00000628306 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
CAPNS1-216ENST00000628306 MARCH7Q9H992 704 aa20.97■□□□□ 0.95
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC25A15Q9Y619 301 aa20.97■□□□□ 0.95
CAPNS1-216ENST00000628306 IGHV4-31P0DP07 118 aa20.97■□□□□ 0.95
CAPNS1-216ENST00000628306 CLUP10909 449 aa20.97■□□□□ 0.95
CAPNS1-216ENST00000628306 CRABP1P29762 137 aa20.97■□□□□ 0.95
CAPNS1-216ENST00000628306 DSCR9P59020 149 aa20.97■□□□□ 0.95
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