RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 DGCR6Q14129 220 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF846Q147U1 533 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SPCS2Q15005 226 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 TRAM2Q15035 370 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 DEFB134Q4QY38 66 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 EIPR1Q53HC9 387 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC25A53Q5H9E4 307 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF311Q5JNZ3 666 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 TPRG1LQ5T0D9 272 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 MEDAGQ5VYS4 303 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SLX4IPQ5VYV7 408 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 C16orf87Q6PH81 154 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CASP12Q6UXS9 341 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 LINC00299Q6ZSB3 139 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 OR56B2PQ8NGI1 322 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 OR6M1Q8NGM8 313 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 OR9A2Q8NGT5 310 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CCL4L1Q8NHW4 92 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF675Q8TD23 568 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 S100ZQ8WXG8 99 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 HIST1H2ACQ93077 130 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 UCN3Q969E3 161 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC38A4Q969I6 547 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 TM4SF19Q96DZ7 209 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SMIM10Q96HG1 83 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 C4orf36Q96KX1 117 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 C10orf90Q96M02 699 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF681Q96N22 645 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 OR2A5Q96R48 311 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 RHNO1Q9BSD3 238 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 RACGAP1Q9H0H5 632 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC26A1Q9H2B4 701 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ANKRD19PQ9H560 264 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 EGLN3Q9H6Z9 239 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 EVA1AQ9H8M9 152 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 FKRPQ9H9S5 495 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ANKHQ9HCJ1 492 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 LYRM4Q9HD34 91 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 HMG20AQ9NP66 347 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 FKBP14Q9NWM8 211 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 GIN1Q9NXP7 522 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 PLEK2Q9NYT0 353 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF226Q9NYT6 803 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 FBXL4Q9UKA2 621 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 PILRBQ9UKJ0 227 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CES1P1Q9UKY3 287 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SATB2Q9UPW6 733 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 IFT52Q9Y366 437 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 NUP210LQ5VU65 1888 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SCN2AQ99250 2005 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 IRGMA1A4Y4 181 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SNTNA6NMZ2 147 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 A8MVM7 634 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 EFCAB9A8MZ26 197 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 C10orf142B7Z368 130 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CLDN25C9JDP6 229 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 H0YGG7 62 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CYR61O00622 381 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 PRRG2O14669 202 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 P2RX6O15547 441 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 AIREO43918 545 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 OR5F1O95221 314 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SOX14O95416 240 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 NADKO95544 446 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 IGHV4-39P01824 125 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 IGHV4-34P06331 123 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 STSP08842 583 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ALOX5P09917 674 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CPMP14384 443 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CD36P16671 472 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 NT5EP21589 574 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CA6P23280 308 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ACKR3P25106 362 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 DPP4P27487 766 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 UGT2B10P36537 528 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 DLSTP36957 453 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 TGFBR2P37173 567 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 PTGFRP43088 359 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CCR4P51679 360 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 RAB38P57729 211 aa3.63□□□□□ -1.83
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