RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589055.3

TMEM259-206, Transcript of transmembrane protein 259, human

TSL 3

Gene TMEM259, Length 791 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM259-206	ENST00000589055	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055	STARD10	Q9Y365	291 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055	OR6C6	A6NF89	314 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055	CLDN25	C9JDP6	229 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055	AHCYL1	O43865	530 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055	COX5B	P10606	129 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055	ITGA2	P17301	1181 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055	ARHGDIA	P52565	204 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055	MXRA7	P84157	204 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055	RFX4	Q33E94	735 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055	FAM209A	Q5JX71	171 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055	CORO6	Q6QEF8	472 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055		Q6ZR03	302 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055	OR4K13	Q8NH42	304 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055	NMNAT3	Q96T66	252 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055	UBOX5	O94941	541 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055	FPR3	P25089	353 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055	SLC6A6	P31641	620 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055	TEK	Q02763	1124 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055	HFE	Q30201	348 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055	MTX3	Q5HYI7	312 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055	C16orf89	Q6UX73	402 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055	OR5AS1	Q8N127	324 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055	OR6V1	Q8N148	313 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055	OR51F2	Q8NH61	342 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055	CMBL	Q96DG6	245 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055	IFT27	Q9BW83	186 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMEM259-206	ENST00000589055	ISPD	A4D126	451 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055		H3BSA7	217 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	DCTN3	O75935	186 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	IGHV2-5	P01817	119 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	ADH4	P08319	380 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	GSTM3	P21266	225 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	THBS2	P35442	1172 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	GSS	P48637	474 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	PRSS12	P56730	875 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	SMIM11A	P58511	58 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	ARL9	Q6T311	187 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	FITM2	Q8N6M3	262 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	B9D1	Q9UPM9	204 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	OR6C68	A6NDL8	312 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	PLPP2	O43688	288 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	AVP	P01185	164 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	KCNMB1	Q16558	191 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	TIMD4	Q96H15	378 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	GAL3ST1	Q99999	423 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	WAC	Q9BTA9	647 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	VNN3	Q9NY84	501 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMEM259-206	ENST00000589055	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		13.5	□□□□□ -0.25

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