RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572369.5

SMG6-211, Transcript of SMG6, nonsense mediated mRNA decay factor, humanhuman

TSL 3

Gene SMG6, Length 689 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG6-211ENST00000572369 TMEM154Q6P9G4 183 aa6.7□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 CLEC2AQ6UVW9 174 aa6.7□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 AMIGO2Q86SJ2 522 aa6.7□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 HIPK1Q86Z02 1210 aa6.7□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa6.7□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 LINC00346Q8IVM7 164 aa6.7□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 C10orf67Q8IYJ2 551 aa6.7□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 OR6V1Q8N148 313 aa6.7□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 LNX2Q8N448 690 aa6.7□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 IQCF1Q8N6M8 205 aa6.7□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 SLC37A3Q8NCC5 494 aa6.7□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 GJC3Q8NFK1 279 aa6.7□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 OR6K6Q8NGW6 343 aa6.7□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 OR5K1Q8NHB7 308 aa6.7□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 ABHD4Q8TB40 342 aa6.7□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 SYNPRQ8TBG9 265 aa6.7□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 SNX33Q8WV41 574 aa6.7□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 LRTOMTQ8WZ04 291 aa6.7□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 NRBF2Q96F24 287 aa6.7□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 POM121L2Q96KW2 1035 aa6.7□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 RHNO1Q9BSD3 238 aa6.7□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 MS4A5Q9H3V2 200 aa6.7□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa6.7□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 LOC100509620A0A075B734 347 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 TRIM64A6NGJ6 449 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 TVP23AA6NH52 213 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 TRIM64BA6NI03 449 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 H7C1Q1 480 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 M0R233 179 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 RER1O15258 196 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 SYNGR3O43761 229 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 MT-ND5P03915 603 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 HMGN1P05114 100 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 GYPBP06028 91 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 COX5BP10606 129 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 FMO3P31513 532 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 ALDH3B1P43353 468 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 PPOXP50336 477 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 EFNA4P52798 201 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 DSCR9P59020 149 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 ERVS71-1P61550 626 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 RPS7P62081 194 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 PPP1CBP62140 327 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 CRMP1Q14194 572 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 TAF13Q15543 124 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 KCNMB1Q16558 191 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 MOGQ16653 247 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 MST1LQ2TV78 715 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 ZNF718Q3SXZ3 478 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 SPATA46Q5T0L3 261 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 CORO6Q6QEF8 472 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 ZBTB46Q86UZ6 589 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 LRP11Q86VZ4 500 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 C1orf174Q8IYL3 243 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 ZNF525Q8N782 197 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 NPEPL1Q8NDH3 523 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 SLC26A10Q8NG04 563 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 OR51L1Q8NGJ5 315 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 OR4Q3Q8NH05 313 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 OR1F12Q8NHA8 337 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 PYDC1Q8WXC3 89 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 DNAJC9Q8WXX5 260 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 FAM168AQ92567 244 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 C4orf45Q96LM5 186 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 SORCS2Q96PQ0 1159 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 PITX2Q99697 317 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 OR51V1Q9H2C8 321 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 TPK1Q9H3S4 243 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 CMC2Q9NRP2 79 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 KRT84Q9NSB2 600 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 REV1Q9UBZ9 1251 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 ENOPH1Q9UHY7 261 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 ARID1AO14497 2285 aa6.69□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 PLSCR5A0PG75 271 aa6.68□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 OR6C6A6NF89 314 aa6.68□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 SAC3D1A6NKF1 404 aa6.68□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 FAM183AA6NL82 134 aa6.68□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 RNF223E7ERA6 249 aa6.68□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 LY6HO94772 140 aa6.68□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 CLPTM1O96005 669 aa6.68□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 TFP02787 698 aa6.68□□□□□ -1.34
SMG6-211ENST00000572369 TP53P04637 393 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
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