RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560521.5

RABGGTA-217, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-217ENST00000560521 UMPSP11172 480 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 EPHA3P29320 983 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 SLC1A6P48664 564 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 SRP9P49458 86 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 NPY4RP50391 375 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 EFNB2P52799 333 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 GUCY1A3Q02108 690 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 NPTX1Q15818 432 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 ENTPD8Q5MY95 495 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 METTL11BQ5VVY1 283 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 CD276Q5ZPR3 534 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 NXNQ6DKJ4 435 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 REEP3Q6NUK4 255 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 CLDN22Q8N7P3 220 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 OR8G5Q8NG78 346 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 OR13G1Q8NGZ3 307 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 PPP1R35Q8TAP8 253 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 GTF2H4Q92759 462 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 HIST1H2ACQ93077 130 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 ITCHQ96J02 903 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 TECTBQ96PL2 329 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 RAD21L1Q9H4I0 556 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 SMURF2Q9HAU4 748 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 HAO1Q9UJM8 370 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 BIRC6Q9NR09 4857 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 SACSQ9NZJ4 4579 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 ANKRD61A6NGH8 418 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 LRRC30A6NM36 301 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 M0R3H8 397 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 COX5BP10606 129 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 RAC2P15153 192 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 GABRA5P31644 462 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 AQP2P41181 271 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 KIR2DS4P43632 304 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 PCBD1P61457 104 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 CDK6Q00534 326 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 DEFB121Q5J5C9 76 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 C6orf10Q5SRN2 563 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 OR2T2Q6IF00 324 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 KRT73Q86Y46 540 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 C1orf87Q8N0U7 546 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 OR6T1Q8NGN1 323 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 MOSPD2Q8NHP6 518 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 SLC7A6Q92536 515 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 ZNF426Q9BUY5 554 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 MMP28Q9H239 520 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 PPA2Q9H2U2 334 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 RMND5AQ9H871 391 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 SMURF1Q9HCE7 757 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 INIPQ9NRY2 104 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 ERVK-18Q9QC07 812 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 TMCC3Q9ULS5 477 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 FAM96BQ9Y3D0 163 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 BTBD17A6NE02 478 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 ATP8B1O43520 1251 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 PPP1R3DO95685 299 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 HLA-DPB1P04440 258 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 FBP1P09467 338 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 TSPAN19P0C672 248 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 FUT1P19526 365 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 GATA4P43694 442 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 DAP3P51398 398 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 CD47Q08722 323 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 MAB21L1Q13394 359 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 LAPTM4AQ15012 233 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 DUSP7Q16829 419 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 GCNT6Q5T4J0 391 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 C1orf94Q6P1W5 598 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 SLC2A7Q6PXP3 512 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 HDDC2Q7Z4H3 204 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 VMO1Q7Z5L0 202 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 SYT9Q86SS6 491 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 ARMC8Q8IUR7 673 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 SLC30A8Q8IWU4 369 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 MSRB3Q8IXL7 192 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 KLHDC1Q8N7A1 406 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 SMYD1Q8NB12 490 aa7.34□□□□□ -1.23
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