RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
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PTPRB-208ENST00000550358 CD300LDQ6UXZ3 194 aa7.73□□□□□ -1.17
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PTPRB-208ENST00000550358 PFN4Q8NHR9 129 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
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PTPRB-208ENST00000550358 SOX15O60248 233 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 DRAM2Q6UX65 266 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 FBXL6Q8N531 539 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 SECTM1Q8WVN6 248 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 UQCC2Q9BRT2 126 aa7.72□□□□□ -1.17
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