RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540486.5

TRAPPC1-202, Transcript of trafficking protein particle complex 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC1, Length 759 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1-202ENST00000540486 SH3GL3Q99963 347 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 IL20Q9NYY1 176 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 GRHPRQ9UBQ7 328 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 MMP24Q9Y5R2 645 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 SLC22A23A1A5C7 686 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 PRSS37A4D1T9 235 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 A6NIZ1 184 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 H7C1C5 153 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 ARPC3O15145 178 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 TIPRLO75663 272 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 PPP1R3DO95685 299 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 OR8G3PP0DMU2 310 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 ANPEPP15144 967 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 SDHAP31040 664 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 IFNGR2P38484 337 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 RAP1BP61224 184 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 LCN6P62502 163 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 RAB1AP62820 205 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 RAP1AP62834 184 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 THEM4Q5T1C6 240 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 MDP1Q86V88 176 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 CCDC36Q8IYA8 594 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 HS3ST5Q8IZT8 346 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 LINC00471Q8N535 108 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 AQP11Q8NBQ7 271 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 OR8D4Q8NGM9 314 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 GIPC3Q8TF64 312 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 NSMAFQ92636 917 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 NABP1Q96AH0 204 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 FEVQ99581 238 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 ALG12Q9BV10 488 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 DGCR6LQ9BY27 220 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 EGLN3Q9H6Z9 239 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 SMURF2Q9HAU4 748 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 REV1Q9UBZ9 1251 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 KLHL21Q9UJP4 597 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 J3QLI3 93 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 DCTN6O00399 190 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 BHLHE40O14503 412 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 SOCS2O14508 198 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 GNGT2O14610 69 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 AHCYL1O43865 530 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 CECR9P0C854 216 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 CD79AP11912 226 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 CTLA4P16410 223 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 PAX7P23759 505 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 CALCRP30988 508 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 ARR3P36575 388 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 CAPZA2P47755 286 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 GIPRP48546 466 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 RPS6KA3P51812 740 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 NAAAQ02083 359 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 HGFACQ04756 655 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 CD47Q08722 323 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 GK3PQ14409 553 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 EFNB3Q15768 340 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 C3orf36Q3SXR2 165 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 NRN1LQ496H8 165 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 FAM27BQ5VT28 67 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 C1orf146Q5VVC0 180 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 FAM205BPQ63HN1 556 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 GPR139Q6DWJ6 353 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 CD300LDQ6UXZ3 194 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 ZNF620Q6ZNG0 422 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 C17orf107Q6ZR85 190 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 HDDC2Q7Z4H3 204 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 ZNF584Q8IVC4 421 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 LRRC18Q8N456 261 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 OR10G2Q8NGC3 310 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 FNDC8Q8TC99 324 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 UBASH3BQ8TF42 649 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 SLC25A28Q96A46 364 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 ZNF570Q96NI8 536 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 TSSK2Q96PF2 358 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 SLC38A2Q96QD8 506 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 NMNAT3Q96T66 252 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 NUAK2Q9H093 628 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 PLK3Q9H4B4 646 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 SIAEQ9HAT2 523 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 LPAR2Q9HBW0 351 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 G6PC2Q9NQR9 355 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 ARMC1Q9NVT9 282 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 DNAJB9Q9UBS3 223 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-202ENST00000540486 MOKQ9UQ07 419 aa7.55□□□□□ -1.2
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