RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
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PTPRB-204ENST00000538708 I3L521 148 aa8.58□□□□□ -1.04
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PTPRB-204ENST00000538708 AIPO00170 330 aa8.57□□□□□ -1.04
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PTPRB-204ENST00000538708 OMGP23515 440 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 ID4P47928 161 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 PRSS42Q7Z5A4 293 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 FJX1Q86VR8 437 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 CDC20BQ86Y33 519 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 RDH5Q92781 318 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 PBOV1Q9GZY1 135 aa8.57□□□□□ -1.04
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