RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CNIH3Q8TBE1 160 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EXTL1Q92935 676 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PNPLA2Q96AD5 504 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MIB2Q96AX9 1013 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SARAFQ96BY9 339 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OXGR1Q96P68 337 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KLHDC3Q9BQ90 382 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KATNB1Q9BVA0 655 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCDC90BQ9GZT6 254 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TXNIPQ9H3M7 391 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FN3KQ9H479 309 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OPA3Q9H6K4 179 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MCCC2Q9HCC0 563 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CMC2Q9NRP2 79 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PTTG2Q9NZH5 202 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 APC2O95996 2303 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A0A087WV48 116 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 H0Y8G0 127 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC1A7O00341 560 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BHLHE40O14503 412 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TNFSF11O14788 317 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARPC3O15145 178 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LDLRAD4O15165 306 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC22A1O15245 554 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARHGEF9O43307 516 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ADAM20O43506 726 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EFNA2O43921 213 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AKR7A3O95154 331 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FABP1P07148 127 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CRYGCP07315 174 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UQCRC1P31930 480 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MLLT10P55197 1068 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SRYQ05066 204 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LTBQ06643 244 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MALLQ13021 153 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ITGADQ13349 1161 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PCGF3Q3KNV8 242 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KLHL12Q53G59 568 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 YIF1BQ5BJH7 314 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC25A30Q5SVS4 291 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C1QL3Q5VWW1 255 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LEG1Q6P5S2 330 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PAQR6Q6TCH4 344 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM180AQ6UWF9 173 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 Q6ZS92 163 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 P4HA3Q7Z4N8 544 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GPR141Q7Z602 305 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PXKQ7Z7A4 578 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GPAT4Q86UL3 456 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGFN1Q86VF2 1251 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TSPAN14Q8NG11 270 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR8D4Q8NGM9 314 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR4Q3Q8NH05 313 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NEIL3Q8TAT5 605 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FNDC8Q8TC99 324 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF524Q96C55 264 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LRR1Q96L50 414 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RBP7Q96R05 134 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PTDSS2Q9BVG9 487 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PALMDQ9NP74 551 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF226Q9NYT6 803 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TAS2R5Q9NYW4 299 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 X6R8D5 127 aa5□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SVILO95425 2214 aa4.99□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A0A0J9YW62 118 aa4.99□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa4.99□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A0A1W2PNV4 684 aa4.99□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AQP7P3A6NL99 342 aa4.99□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF716A6NP11 495 aa4.99□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CLCA1A8K7I4 914 aa4.99□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FTCDNL1E5RQL4 147 aa4.99□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MS4A18H0YCH9 400 aa4.99□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RGS10O43665 173 aa4.99□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRKYO43930 277 aa4.99□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ENTPD6O75354 484 aa4.99□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CLPXO76031 633 aa4.99□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TGM6O95932 706 aa4.99□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SCGB1D1O95968 90 aa4.99□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF735P0CB33 412 aa4.99□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MYL12AP19105 171 aa4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.9 ms