RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 ABCD4O14678 606 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 WISP2O76076 250 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 FARS2O95363 451 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 CH25HO95992 272 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 TFPTP0C1Z6 253 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 DANCRP0C864 163 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 LAMP1P11279 417 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF43P17038 809 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ENTPD1P49961 510 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 CASP9P55211 416 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 DSTNP60981 165 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 SLC3A1Q07837 685 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 SLC17A1Q14916 467 aa3.63□□□□□ -1.83
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HDAC2-216ENST00000523628 CHI3L2Q15782 390 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 NPTX1Q15818 432 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 PCGF3Q3KNV8 242 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 COQ5Q5HYK3 327 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 SIGIRRQ6IA17 410 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 REEP3Q6NUK4 255 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 WDR73Q6P4I2 378 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ERICH5Q6P6B1 374 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ULK3Q6PHR2 472 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ARL9Q6T311 187 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 CASP12Q6UXS9 341 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ZER1Q7Z7L7 766 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 HIPK1Q86Z02 1210 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 TUSC5Q8IXB3 177 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 OR8H2Q8N162 312 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 OR7A2PQ8NGA2 310 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 OR1J2Q8NGS2 313 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 OR2T11Q8NH01 316 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 OR5R1Q8NH85 324 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 MGARPQ8TDB4 240 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ABHD3Q8WU67 409 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 SGCDQ92629 289 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 SLC47A1Q96FL8 570 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 TXNDC15Q96J42 360 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 MAGEB18Q96M61 343 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ABHD1Q96SE0 405 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM43Q9BTV4 400 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC28BQ9BUN5 200 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF416Q9BWM5 594 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 REG4Q9BYZ8 158 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 OR51I1Q9H343 314 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 TUBB1Q9H4B7 451 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF385DQ9H6B1 395 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM38AQ9H6F2 299 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 COQ10BQ9H8M1 238 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 SLC17A5Q9NRA2 495 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 AIG1Q9NVV5 245 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 KCNS2Q9ULS6 477 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ANGPT4Q9Y264 503 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 TMED7Q9Y3B3 224 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 CMAHPQ9Y471 501 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa3.63□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ZFHX3Q15911 3703 aa3.62□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ATRQ13535 2644 aa3.62□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa3.62□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 hDV102S1A0JD36 115 aa3.62□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF716A6NP11 495 aa3.62□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 BBIP1A8MTZ0 92 aa3.62□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 M0QZ24 198 aa3.62□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 CTDSP2O14595 271 aa3.62□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 UBDO15205 165 aa3.62□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 SLC22A2O15244 555 aa3.62□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 CLOCKO15516 846 aa3.62□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 UBL3O95164 117 aa3.62□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 OR6A2O95222 327 aa3.62□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 H6PDO95479 791 aa3.62□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 IGKV1D-16P01601 117 aa3.62□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 IGKV3-15P01624 115 aa3.62□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 SHBGP04278 402 aa3.62□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 HIST1H2ABP04908 130 aa3.62□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 CHRNGP07510 517 aa3.62□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 T-ENOLP0DO92 83 aa3.62□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 THRBP10828 461 aa3.62□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 MMP9P14780 707 aa3.62□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 USF1P22415 310 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 CRATP43155 626 aa3.62□□□□□ -1.83
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