RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522344.1

CPEB4-210, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene CPEB4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB4-210ENST00000522344 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 OR52H1Q8NGJ2 320 aa2.15□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 PPTC7Q8NI37 304 aa2.15□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF461Q8TAF7 563 aa2.15□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa2.15□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 OR2A5Q96R48 311 aa2.15□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 CLCC1Q96S66 551 aa2.15□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 PXMP2Q9NR77 195 aa2.15□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 GIN1Q9NXP7 522 aa2.15□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 SPATA7Q9P0W8 599 aa2.15□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 GGA2Q9UJY4 613 aa2.15□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 AURKCQ9UQB9 309 aa2.15□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 KNL1Q8NG31 2342 aa2.15□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 CCDC171Q6TFL3 1326 aa2.15□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa2.15□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 APC2O95996 2303 aa2.14□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 C5orf67F2Z3F1 127 aa2.14□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 MED7O43513 233 aa2.14□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa2.14□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa2.14□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 IGHV3-43DP0DP04 118 aa2.14□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 PRPS2P11908 318 aa2.14□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 PSMC3P17980 439 aa2.14□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 CELP19835 753 aa2.14□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 OMGP23515 440 aa2.14□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 PAX7P23759 505 aa2.14□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 GNA11P29992 359 aa2.14□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 RGS4P49798 205 aa2.14□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 RAP1AP62834 184 aa2.14□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 CACNG7P62955 275 aa2.14□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 MGAT3Q09327 533 aa2.14□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 ALX1Q15699 326 aa2.14□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 TTLL9Q3SXZ7 439 aa2.14□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 COX19Q49B96 90 aa2.14□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 FAM92BQ6ZTR7 304 aa2.14□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 PLA2G4DQ86XP0 818 aa2.14□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 UBALD2Q8IYN6 164 aa2.14□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF679Q8IYX0 411 aa2.14□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 OR52P1PQ8NH57 321 aa2.14□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 PDXPQ96GD0 296 aa2.14□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 OR10C1Q96KK4 312 aa2.14□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 OXGR1Q96P68 337 aa2.14□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 TGM7Q96PF1 710 aa2.14□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 RAB18Q9NP72 206 aa2.14□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 XCL2Q9UBD3 114 aa2.14□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 CD84Q9UIB8 345 aa2.14□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa2.14□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 IGSF10Q6WRI0 2623 aa2.14□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 RAD50Q92878 1312 aa2.14□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 NUMA1Q14980 2115 aa2.14□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa2.13□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa2.13□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 CCDC182A6NF36 153 aa2.13□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 LOC730098B7Z3J9 87 aa2.13□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 IGKV4-1P06312 121 aa2.13□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 HSMCR30P0CW71 290 aa2.13□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 LAP3P28838 519 aa2.13□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 MDH1P40925 334 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 QARSP47897 775 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 SP4Q02446 784 aa2.13□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 GPM6BQ13491 265 aa2.13□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 OR5I1Q13606 314 aa2.13□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 PRSS8Q16651 343 aa2.13□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 VAX1Q5SQQ9 334 aa2.13□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 H2AFVQ71UI9 128 aa2.13□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 TMEM123Q8N131 208 aa2.13□□□□□ -2.07
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CPEB4-210ENST00000522344 FGF14Q92915 247 aa2.13□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 TOP1MTQ969P6 601 aa2.13□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 CXorf40BQ96DE9 158 aa2.13□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
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CPEB4-210ENST00000522344 LAMP5Q9UJQ1 280 aa2.13□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 NAV2Q8IVL1 2488 aa2.13□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 PCDH15Q96QU1 1955 aa2.12□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 LAMA5O15230 3695 aa2.12□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa2.12□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa2.12□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 ZBTB5O15062 677 aa2.12□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 SRP72O76094 671 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 PLEKHA8P1O95397 391 aa2.12□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 CCNE2O96020 404 aa2.12□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
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