RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 MS4A8Q9BY19 250 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 SPNS1Q9H2V7 528 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 RHBGQ9H310 441 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 PIGUQ9H490 435 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 DPEP2Q9H4A9 486 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 C11orf49Q9H6J7 331 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 OPA3Q9H6K4 179 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 NT5DC2Q9H857 520 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 JPT2Q9H910 190 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 TIGARQ9NQ88 270 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 PLSCR3Q9NRY6 295 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 MED17Q9NVC6 651 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 B3GNT2Q9NY97 397 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 P2RX2Q9UBL9 471 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 FBXW2Q9UKT8 454 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 CLEC4EQ9ULY5 219 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 ALG5Q9Y673 324 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 OBSL1O75147 1896 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 LINC00862A6NCI5 91 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 SNTNA6NMZ2 147 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 A8MV72 311 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 H3BN98 237 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 WWP2O00308 870 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 HMGN4O00479 90 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 GABRPO00591 440 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 PLPP1O14494 284 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 SURF4O15260 269 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 LYRM1O43325 122 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 CHST10O43529 356 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 ORC5O43913 435 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 OR10H3O60404 316 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 NME6O75414 186 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 MTX2O75431 263 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 NXPH4O95158 308 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 CRYZL1O95825 349 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 EPPINO95925 133 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 TSPAN19P0C672 248 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 LIMS3P0CW19 117 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 LIMS4P0CW20 117 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 M6PRP20645 277 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 MMP11P24347 488 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 HOXD10P28358 340 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 SLC6A1P30531 599 aa3.57□□□□□ -1.84
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SGCE-211ENST00000522045 HTR2BP41595 481 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 SLC1A3P43003 542 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 TGM4P49221 684 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 EVX1P49640 407 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 FABP5Q01469 135 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 FUT5Q11128 374 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 CNTN1Q12860 1018 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 TSPAN31Q12999 210 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 RPA4Q13156 261 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 MAB21L1Q13394 359 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 ARHGAP19Q14CB8 494 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 ANGPT1Q15389 498 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 PGGHGQ32M88 737 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 CCDC58Q4VC31 144 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 PYDC2Q56P42 97 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 EOGTQ5NDL2 527 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 AADACL4Q5VUY2 407 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 CST9Q5W186 159 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 OLFML2AQ68BL7 652 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 HBMQ6B0K9 141 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 TMEM211Q6ICI0 200 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 PODNL1Q6PEZ8 512 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 TMEM107Q6UX40 140 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 COMTD1Q86VU5 262 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 C9orf62Q8N4C0 152 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 CD177Q8N6Q3 437 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 VN1R2Q8NFZ6 395 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 OR4M1Q8NGD0 313 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 OR4K5Q8NGD3 323 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 OR8D4Q8NGM9 314 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 OR52P1PQ8NH57 321 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 OR5AK3PQ8NH89 298 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 HGDQ93099 445 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 UCN3Q969E3 161 aa3.57□□□□□ -1.84
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