RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	GPR84	Q9NQS5	396 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	PLA2G10	O15496	165 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	SLC34A2	O95436	690 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	OR4E1	P0C645	316 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF728	P0DKX0	622 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	GABRG2	P18507	467 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	P2RX3	P56373	397 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	EGR3	Q06889	387 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	TOR2A	Q5JU69	321 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	RTL6	Q6ICC9	239 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF425	Q6IV72	752 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	CBLN3	Q6UW01	205 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	TEX261	Q6UWH6	196 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	PGAP1	Q75T13	922 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	OR52N5	Q8NH56	324 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	LRRC46	Q96FV0	321 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	FAM60A	Q9NP50	221 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	MMP25	Q9NPA2	562 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193		U3KQ87	197 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193		H0YIG0	161 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	OPRM1	P35372	400 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	SERPINF1	P36955	418 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	SSR4	P51571	173 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	PCBD1	P61457	104 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	BAMBI	Q13145	260 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	STK11	Q15831	433 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF79	Q15937	498 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	H3F3C	Q6NXT2	135 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	RNF128	Q8TEB7	428 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	PSMF1	Q92530	271 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	PTP4A1	Q93096	173 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	ARPC3	O15145	178 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	XRCC3	O43542	346 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	GNB3	P16520	340 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	GPR85	P60893	370 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	DUSP2	Q05923	314 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	IKZF1	Q13422	519 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	ZIC1	Q15915	447 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	SPRED2	Q7Z698	418 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	MAP6	Q96JE9	813 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	LY75	O60449	1722 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	TET1	Q8NFU7	2136 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193		D6RAR5	112 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	TPO	P07202	933 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	CARD18	P57730	90 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	ZAR1	Q86SH2	424 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	NUDT9	Q9BW91	350 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	FOXQ1	Q9C009	403 aa		7.29	□□□□□ -1.24

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