RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 PPP1CBP62140 327 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 LSM6P62312 80 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 BNIP1Q12981 228 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 KCNMB1Q16558 191 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 C6orf52Q5T4I8 152 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 DNM1P34Q6PK57 102 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 CFAP77Q6ZQR2 320 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 ZBTB46Q86UZ6 589 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 SPATA24Q86W54 205 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 AQP12AQ8IXF9 295 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF786Q8N393 782 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 C4orf45Q96LM5 186 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 DGCR6LQ9BY27 220 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 IL20Q9NYY1 176 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 DYSFO75923 2080 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 C17orf100A8MU93 164 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 IGHV3-13P01766 116 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 COL8A2P25067 703 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 GIFP27352 417 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 RPS27P42677 84 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 RIN1Q13671 783 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 LINC00471Q8N535 108 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 IQCF1Q8N6M8 205 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC37A3Q8NCC5 494 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 SLCO4A1Q96BD0 722 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 DDOQ99489 341 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 TSSK6Q9BXA6 273 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 MS4A5Q9H3V2 200 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 YAE1D1Q9NRH1 226 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 COX5BP10606 129 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 RBMXP38159 391 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 MMP15P51511 669 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 HIST1H3AP68431 136 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 CCL8P80075 99 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 PPP2R2BQ00005 443 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 TEKQ02763 1124 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 HIST2H3AQ71DI3 136 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 OR51L1Q8NGJ5 315 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 OR1F12Q8NHA8 337 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 SNX33Q8WV41 574 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 FEVQ99581 238 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 TVP23AA6NH52 213 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 WNT9BO14905 357 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 GSC2O15499 205 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 IDH3BO43837 385 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 LILRA1O75019 489 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 FKBP6O75344 327 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 RP2O75695 350 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 GYPBP06028 91 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 CLUP10909 449 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 ANOS1P23352 680 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 GGT2P36268 569 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 COX10Q12887 443 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 CRMP1Q14194 572 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 TSTQ16762 297 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF718Q3SXZ3 478 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC36A3Q495N2 470 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 SPRNQ5BIV9 151 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC18B1Q6NT16 456 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 PRIMA1Q86XR5 153 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 LNX2Q8N448 690 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 WACQ9BTA9 647 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 NARFLQ9H6Q4 476 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 CACNG2Q9Y698 323 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 JMJD1CQ15652 2540 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 CDC14BO60729 498 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 IGHV1-46P01743 117 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 HLA-DQA2P01906 255 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF23P17027 643 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 GCH1P30793 250 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 CBX1P83916 185 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 CCNIQ14094 377 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM154Q6P9G4 183 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 PROKR2Q8NFJ6 384 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 GIPC3Q8TF64 312 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 HCAR1Q9BXC0 346 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 MSL2Q9HCI7 577 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 ARRDC5A6NEK1 342 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 SPRY3O43610 288 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 GSTM3P21266 225 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2-218ENST00000511185 PRSS12P56730 875 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.7 ms