RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 C1orf198Q9H425 327 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 PLEKHA1Q9HB21 404 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM206AQ9NX38 181 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 STMN3Q9NZ72 180 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 GLTPQ9NZD2 209 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 FOXJ3Q9UPW0 622 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 ETV7Q9Y603 341 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 SDK2Q58EX2 2172 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 PTPRBP23467 1997 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 EML6Q6ZMW3 1958 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 MEIOCA2RUB1 952 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 PINLYPA6NC86 204 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 GJE1A6NN92 205 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 RRP8O43159 456 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 SULT1B1O43704 296 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 TNFSF15O95150 251 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 QDPRP09417 244 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 H2BFMP0C1H6 154 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 FSTP19883 344 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 CD96P40200 585 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 CYB561P49447 251 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 CLDN17P56750 224 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 CLDN20P56880 219 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 RAC3P60763 192 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 GPR176Q14439 515 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 CARTPTQ16568 116 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 PHYHD1Q5SRE7 291 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM244Q5VVB8 128 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 CARD17Q5XLA6 110 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 CORO6Q6QEF8 472 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 GGNQ86UU5 652 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 LYPD6Q86Y78 171 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 ELMOD2Q8IZ81 293 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM123Q8N131 208 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 OR9K2Q8NGE7 335 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC39A7Q92504 469 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 OR2M2Q96R28 347 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 UCN2Q96RP3 112 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 SRXN1Q9BYN0 137 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 RNF121Q9H920 327 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 LIN7BQ9HAP6 207 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 EMC7Q9NPA0 242 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 HHLA2Q9UM44 414 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 EMC9Q9Y3B6 208 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A0B4J293 547 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A1W2PPL8 197 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 HMX3A6NHT5 357 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 NEURL1O76050 574 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 MAS1P04201 325 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 TRAPPC2P0DI81 140 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 TRAPPC2BP0DI82 140 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 NR2C1P13056 603 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 CTSSP25774 331 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC6A1P30531 599 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 CDAP32320 146 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 DDOSTP39656 456 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 PTH2RP49190 550 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 CLDN15P56746 228 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 CLDN12P56749 244 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 LSM6P62312 80 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 HIST1H3AP68431 136 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 DGCR2P98153 550 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 ODF4Q2M2E3 257 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 PLA1AQ53H76 456 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 DCAF10Q5QP82 559 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 CFAP77Q6ZQR2 320 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 DNM1P46Q6ZS02 220 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 HIST2H3AQ71DI3 136 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 C20orf196Q8IYI0 205 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 UBE2J2Q8N2K1 259 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 DNAAF1Q8NEP3 725 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 SYNPRQ8TBG9 265 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 ENKURQ8TC29 256 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 RAB40AQ8WXH6 277 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 NKD1Q969G9 470 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC25A28Q96A46 364 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 HAVCR1Q96D42 359 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 IP6K3Q96PC2 410 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 MARVELD1Q9BSK0 173 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 HDHD2Q9H0R4 259 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 NIPAL2Q9H841 368 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 ZFP64Q9NPA5 681 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 CENPMQ9NSP4 180 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 STEAP1Q9UHE8 339 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-209ENST00000504450 IL17BQ9UHF5 180 aa9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms