RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 OR8B4Q96RC9 309 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGEF1-211ENST00000503687 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
RABGEF1-211ENST00000503687 TXNIPQ9H3M7 391 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGEF1-211ENST00000503687 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
RABGEF1-211ENST00000503687 A0A0A6YYH2 397 aa11.52□□□□□ -0.56
RABGEF1-211ENST00000503687 A6NJ64 397 aa11.52□□□□□ -0.56
RABGEF1-211ENST00000503687 XRCC3O43542 346 aa11.52□□□□□ -0.56
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RABGEF1-211ENST00000503687 SMIM10L1P0DMW3 83 aa11.52□□□□□ -0.56
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RABGEF1-211ENST00000503687 OR14L1PQ8NHC6 308 aa11.52□□□□□ -0.56
RABGEF1-211ENST00000503687 SLAMF6Q96DU3 332 aa11.52□□□□□ -0.56
RABGEF1-211ENST00000503687 RAB3CQ96E17 227 aa11.52□□□□□ -0.56
RABGEF1-211ENST00000503687 SMIM10Q96HG1 83 aa11.52□□□□□ -0.56
RABGEF1-211ENST00000503687 PRRT1Q99946 306 aa11.52□□□□□ -0.56
RABGEF1-211ENST00000503687 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.56
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RABGEF1-211ENST00000503687 CHST6Q9GZX3 395 aa11.52□□□□□ -0.56
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RABGEF1-211ENST00000503687 SRPK3Q9UPE1 567 aa11.52□□□□□ -0.56
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC5A6Q9Y289 635 aa11.52□□□□□ -0.56
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RABGEF1-211ENST00000503687 ABOP16442 354 aa11.52□□□□□ -0.57
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RABGEF1-211ENST00000503687 FOXF1Q12946 379 aa11.52□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa11.52□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
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RABGEF1-211ENST00000503687 SCMH1Q96GD3 660 aa11.52□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 KCNJ15Q99712 375 aa11.52□□□□□ -0.57
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RABGEF1-211ENST00000503687 EVA1AQ9H8M9 152 aa11.52□□□□□ -0.57
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RABGEF1-211ENST00000503687 PTTG3PQ9NZH4 202 aa11.52□□□□□ -0.57
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RABGEF1-211ENST00000503687 METTL12A8MUP2 240 aa11.51□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 CTAG2O75638 210 aa11.51□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 CFDP00746 253 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 HLA-DQB1P01920 261 aa11.51□□□□□ -0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 S100A6P06703 90 aa11.51□□□□□ -0.57
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