RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498524.5

ANKRD28-213, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,289 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-213ENST00000498524 WBP2Q969T9 261 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 EID2BQ96D98 161 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 C5orf30Q96GV9 206 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 C4orf36Q96KX1 117 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 ACTRT3Q9BYD9 372 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 NOX3Q9HBY0 568 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 PRDM9Q9NQV7 894 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 A0A087WUU8 490 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 GXYLT2A0PJZ3 443 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 TEX46H3BTG2 121 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 TRIM77I1YAP6 450 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 HMGN4O00479 90 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 SCO1O75880 301 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 NSA2O95478 260 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 HLA-DQA2P01906 255 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 ZGLP1P0C6A0 271 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 NPPBP16860 134 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 ZP3P21754 424 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 HTR2AP28223 471 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 S100A11P31949 105 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 GFERP55789 205 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 ATP5J2P56134 94 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 RAE1P78406 368 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 SHBQ15464 509 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 PRSS53Q2L4Q9 553 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC25A30Q5SVS4 291 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 METRNLQ641Q3 311 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 TMEM215Q68D42 235 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 GSG1LQ6UXU4 331 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 CD163Q86VB7 1156 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 ADGRG3Q86Y34 549 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 FDCSPQ8NFU4 85 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 FAM57AQ8TBR7 257 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 SCARB1Q8WTV0 552 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 RAB40AQ8WXH6 277 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 DDOQ99489 341 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 MS4A8Q9BY19 250 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 OR8D2Q9GZM6 311 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 PRDM13Q9H4Q3 707 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 CDCP1Q9H5V8 836 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 FBXO34Q9NWN3 711 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 CLEC4EQ9ULY5 219 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC7A7Q9UM01 511 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 MYLKQ15746 1914 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 TSC2P49815 1807 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC5A10A0PJK1 596 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 NPIPA3F8WFD2 350 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 HS3ST1O14792 307 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 ACTL6AO96019 429 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 HLA-DQB1P01920 261 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 TK1P04183 234 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 IFNA6P05013 189 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 ATP1B1P05026 303 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 DBIP07108 87 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 LIMS3P0CW19 117 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 LIMS4P0CW20 117 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 GTF2F2P13984 249 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 RAB3AP20336 220 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 SOX18P35713 384 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 VEGFCP49767 419 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 CCR6P51684 374 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 OR12D2P58182 307 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 ACTBP60709 375 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 CDK5Q00535 292 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 CCSMST1Q4G0I0 132 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 FAM69BQ5VUD6 431 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 ABHD17CQ6PCB6 329 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 TMEM64Q6YI46 380 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 SIRT6Q8N6T7 355 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 MORN4Q8NDC4 146 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 OR51A7Q8NH64 312 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 ABHD4Q8TB40 342 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 THAP6Q8TBB0 222 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 SMPDL3BQ92485 455 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 PHYHIPQ92561 330 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 SPSB4Q96A44 273 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 GPR137Q96N19 417 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 MS4A4EQ96PG1 132 aa3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms