RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495232.5

CSNK1E-213, Transcript of casein kinase 1 epsilon, human

TSL 2

Gene CSNK1E, Length 669 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK1E-213	ENST00000495232	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232		B9A039	149 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	SYNGR3	O43761	229 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	PRKY	O43930	277 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	ABHD16A	O95870	558 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	GGT2	P36268	569 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	ART1	P52961	327 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	ECH1	Q13011	328 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	APOF	Q13790	326 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	TAF13	Q15543	124 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	TRIP10	Q15642	601 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	ADIPOQ	Q15848	244 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	C12orf73	Q69YU5	71 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	SHF	Q7M4L6	423 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	DTX2	Q86UW9	622 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	TMEM163	Q8TC26	289 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	PERP	Q96FX8	193 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	C4orf45	Q96LM5	186 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	COQ7	Q99807	217 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	C8orf4	Q9NR00	106 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	GPRIN2	O60269	458 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	GCH1	P30793	250 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	CDKN1A	P38936	164 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	HIST1H3A	P68431	136 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	TEX30	Q5JUR7	227 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	GID4	Q8IVV7	300 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	ABHD4	Q8TB40	342 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	SPTSSA	Q969W0	71 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	COG8	Q96MW5	612 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	TEAD3	Q99594	435 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	SLC29A1	Q99808	456 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	ATF6B	Q99941	703 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	FOXC2	Q99958	501 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	TOR3A	Q9H497	397 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	CENPM	Q9NSP4	180 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	DUSP13	Q9UII6	198 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	GPR160	Q9UJ42	338 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	FZR1	Q9UM11	496 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	AKAP9	Q99996	3911 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	PLCE1	Q9P212	2302 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232		A0A1W2PPW3	197 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232		F5H5K5	113 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232		M0R129	80 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	CD8A	P01732	235 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	WNT5A	P41221	380 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	PTH2R	P49190	550 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	EVX1	P49640	407 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	RGS6	P49758	472 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	ATP5J2	P56134	94 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	TPTE	P56180	551 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	EFNB3	Q15768	340 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	MOG	Q16653	247 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
CSNK1E-213	ENST00000495232	SLC7A6	Q92536	515 aa		10.41	□□□□□ -0.74

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