RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491581.5

HDAC3-211, Transcript of histone deacetylase 3, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC3, Length 777 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3-211ENST00000491581 SELENOVP59797 346 aa7.5□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 CDK5R2Q13319 367 aa7.5□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa7.5□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 DCAF12L2Q5VW00 463 aa7.5□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 LIPNQ5VXI9 398 aa7.5□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 ZER1Q7Z7L7 766 aa7.5□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 ZDHHC22Q8N966 263 aa7.5□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 LZICQ8WZA0 190 aa7.5□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 ELMOD3Q96FG2 381 aa7.5□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 NMNAT3Q96T66 252 aa7.5□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa7.5□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 NRIP3Q9NQ35 241 aa7.5□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 ARL8BQ9NVJ2 186 aa7.5□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa7.5□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 PLEK2Q9NYT0 353 aa7.5□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 ADA2Q9NZK5 511 aa7.5□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 ABCD2Q9UBJ2 740 aa7.5□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 LHFPL6Q9Y693 200 aa7.5□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 PLSCR5A0PG75 271 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 OR6C6A6NF89 314 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 UNC119BA6NIH7 251 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 A6NIZ1 184 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 C12orf71A8MTZ7 269 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 F5H5P2 479 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 FSHBP01225 129 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 SEMG1P04279 462 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 PYCR1P32322 319 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 RAP1BP61224 184 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 RAP1AP62834 184 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 ACTG1P63261 375 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 PCGF3Q3KNV8 242 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 MTX3Q5HYI7 312 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 LEG1Q6P5S2 330 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 LYPD2Q6UXB3 125 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 HDDC2Q7Z4H3 204 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 DPPA2Q7Z7J5 298 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 OR6V1Q8N148 313 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 DEFB108BQ8NET1 73 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 SDR9C7Q8NEX9 313 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 OR51L1Q8NGJ5 315 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 OR4K13Q8NH42 304 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 OR1F12Q8NHA8 337 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 SAMD8Q96LT4 415 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 OR2V2Q96R30 315 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 EGLN3Q9H6Z9 239 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 C7orf69Q9H7B7 122 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 EFCAB1Q9HAE3 211 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 TMEM106BQ9NUM4 274 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 VNN3Q9NY84 501 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF69Q9UC07 566 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 RPS6KA6Q9UK32 745 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 PCDHB10Q9UN67 800 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 NPTNQ9Y639 398 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 TENM1Q9UKZ4 2725 aa7.49□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 OR6C68A6NDL8 312 aa7.48□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 TVP23AA6NH52 213 aa7.48□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 XKRYO14609 159 aa7.48□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 ICMTO60725 284 aa7.48□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 NDUFB2O95178 105 aa7.48□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa7.48□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 SDHAP31040 664 aa7.48□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 MMP16P51512 607 aa7.48□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 SPIBQ01892 262 aa7.48□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 FAM209AQ5JX71 171 aa7.48□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa7.48□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa7.48□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 SMARCD3Q6STE5 483 aa7.48□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 C12orf54Q6X4T0 127 aa7.48□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 C1QL2Q7Z5L3 287 aa7.48□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 GLB1L2Q8IW92 636 aa7.48□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa7.48□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 FGFRL1Q8N441 504 aa7.48□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa7.48□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 ATG16L2Q8NAA4 619 aa7.48□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 CYB561A3Q8NBI2 242 aa7.48□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 OR9Q2Q8NGE9 314 aa7.48□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 OR8D4Q8NGM9 314 aa7.48□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 OR10S1Q8NGN2 331 aa7.48□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 RAB1CQ92928 201 aa7.48□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 RAB39BQ96DA2 213 aa7.48□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 OR52D1Q9H346 318 aa7.48□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 GCM1Q9NP62 436 aa7.48□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
HDAC3-211ENST00000491581 GPR160Q9UJ42 338 aa7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms