RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	NABP1	Q96AH0	204 aa		14.83	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		14.83	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	NMNAT3	Q96T66	252 aa		14.83	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		14.83	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		14.83	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	14.83	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	ATR	Q13535	2644 aa		14.82	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	LMX1B	O60663	402 aa		14.82	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	ACHE	P22303	614 aa		14.82	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	CDA	P32320	146 aa		14.82	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	GRK5	P34947	590 aa		14.82	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	APLNR	P35414	380 aa		14.82	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	ESRRG	P62508	458 aa		14.82	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	HSF2	Q03933	536 aa		14.82	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	GLO1	Q04760	184 aa		14.82	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		14.82	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	OR2T4	Q8NH00	348 aa		14.82	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		14.82	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	RDH5	Q92781	318 aa		14.82	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	MDFI	Q99750	246 aa		14.82	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		14.82	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		14.82	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	NUAK2	Q9H093	628 aa		14.82	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	CHODL	Q9H9P2	273 aa		14.82	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	S100A14	Q9HCY8	104 aa		14.82	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		14.82	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		14.82	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV3-13	P01766	116 aa		14.81	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	HLA-DQA2	P01906	255 aa		14.81	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	PATE4	P0C8F1	98 aa		14.81	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	COX5B	P10606	129 aa		14.81	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	14.81	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	GGTLC2	Q14390	218 aa		14.81	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	GINS1	Q14691	196 aa		14.81	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	MSMP	Q1L6U9	139 aa		14.81	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	FAHD1	Q6P587	224 aa		14.81	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	PARP8	Q8N3A8	854 aa		14.81	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		14.81	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		14.81	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	14.81	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	14.81	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		14.81	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	BEX2	Q9BXY8	128 aa		14.81	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		14.81	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	14.81	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	POLE4	Q9NR33	117 aa		14.81	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	14.81	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	14.81	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	B9D1	Q9UPM9	204 aa		14.81	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	14.81	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		14.81	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		14.8	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		14.8	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	LILRA1	O75019	489 aa		14.8	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	BAG2	O95816	211 aa		14.8	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	MT-ND5	P03915	603 aa		14.8	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	CTLA4	P16410	223 aa		14.8	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	PCMT1	P22061	227 aa		14.8	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	STOM	P27105	288 aa		14.8	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	LIPA	P38571	399 aa		14.8	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	DAP	P51397	102 aa		14.8	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	BLVRA	P53004	296 aa		14.8	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	CRISP1	P54107	249 aa		14.8	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	14.8	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		14.8	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	ARL9	Q6T311	187 aa		14.8	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		14.8	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		14.8	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	OTULIN	Q96BN8	352 aa		14.8	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	14.8	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		14.8	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	PKP2	Q99959	881 aa		14.8	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		14.8	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		14.8	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		14.8	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	CMC2	Q9NRP2	79 aa		14.8	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		14.8	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		14.79	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		14.79	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF823	P16415	610 aa		14.79	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	IGFBP5	P24593	272 aa		14.79	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	TEK	Q02763	1124 aa		14.79	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		14.79	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		14.79	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		14.79	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		14.79	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	14.79	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		14.79	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	14.79	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		14.79	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	SNX33	Q8WV41	574 aa		14.79	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		14.79	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	14.79	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		14.79	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	DUSP13	Q9UII6	198 aa		14.79	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	OR6C68	A6NDL8	312 aa		14.78	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	ERICH4	A6NGS2	130 aa		14.78	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	C17orf100	A8MU93	164 aa		14.78	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	14.78	□□□□□ -0.04
HDAC10-216	ENST00000489424		H3BNX3	289 aa		14.78	□□□□□ -0.04

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