RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 KRT33AO76009 404 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 TACSTD2P09758 323 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 IL7P13232 177 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 M6PRP20645 277 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 GALP22466 123 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 GIFP27352 417 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 TGFBR1P36897 503 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC1A3P43003 542 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 RFX2P48378 723 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 LGALS3BPQ08380 585 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 FUT5Q11128 374 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 COX10Q12887 443 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 C1DQ13901 141 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 LAPTM4AQ15012 233 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 EFNB3Q15768 340 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 C12orf73Q69YU5 71 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 PAQR6Q6TCH4 344 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 FRRS1Q6ZNA5 592 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF767PQ75MW2 155 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 GPAT4Q86UL3 456 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 NOXA1Q86UR1 476 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 CLIP4Q8N3C7 705 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 TMEM99Q8N816 258 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 ZIC4Q8N9L1 334 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 DUSP18Q8NEJ0 188 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 OR9K2Q8NGE7 335 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 OR4A15Q8NGL6 344 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 OR8J1Q8NGP2 316 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 OR1K1Q8NGR3 316 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 AP3S1Q92572 193 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC25A46Q96AG3 418 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 TMEM45BQ96B21 275 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 TMEM80Q96HE8 168 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 ASPNQ9BXN1 380 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 SEC61A2Q9H9S3 476 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 OBP2BQ9NPH6 170 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF208O43345 1280 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 GPX5O75715 221 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 DIRAS1O95057 198 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 AKR7A3O95154 331 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 VENTXO95231 258 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 AGR2O95994 175 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 CECR9P0C854 216 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 OSMP13725 252 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 TACR3P29371 465 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 CALCRP30988 508 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 RCVRNP35243 200 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 CRYBB2P43320 205 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 NAAAQ02083 359 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 SPHARQ15513 63 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 OR7A5Q15622 319 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF79Q15937 498 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 TSTQ16762 297 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 GPAT3Q53EU6 434 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 ANKRD16Q6P6B7 361 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 NRARPQ7Z6K4 114 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 NANOGP1Q8N7R0 232 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 PMM1Q92871 262 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 TPD52L3Q96J77 140 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 POLE3Q9NRF9 147 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 ACOXLQ9NUZ1 547 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 AASSQ9UDR5 926 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 METRNQ9UJH8 293 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 SSR3Q9UNL2 185 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 ANGPT4Q9Y264 503 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 CMAHPQ9Y471 501 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 A0A096LPE4 126 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 A0A1W2PPZ6 126 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF587BE7ETH6 402 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 LYNX1G3V0Z9 82 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 CTDSP2O14595 271 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 TPST2O60704 377 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 GADD45GO95257 159 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 LYNX1P0DP58 116 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 IFNGR1P15260 489 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 SPIBQ01892 262 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 SCARB2Q14108 478 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 PTCHD4Q6ZW05 846 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 ZFAND1Q8TCF1 268 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 OIT3Q8WWZ8 545 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms