RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480104.5

USP11-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 11, humanhuman

TSL 3

Gene USP11, Length 697 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11-208ENST00000480104 GYPAP02724 150 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 BGLAPP02818 100 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 LINC00032P0C843 101 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 BLCAPP62952 87 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 OR8B8Q15620 311 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 PLA1AQ53H76 456 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 NCR3LG1Q68D85 454 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 C10orf99Q6UWK7 81 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 NUDCD3Q8IVD9 361 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 PEX5LQ8IYB4 626 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 OR4X2Q8NGF9 303 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 OR4A15Q8NGL6 344 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 MCHR2Q969V1 340 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 ZNF347Q96SE7 839 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 TM2D3Q9BRN9 247 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 OR2H1Q9GZK4 316 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 DPH5Q9H2P9 285 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 TUBB1Q9H4B7 451 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 SIAEQ9HAT2 523 aa9.52□□□□□ -0.89
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USP11-208ENST00000480104 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 TMEM216Q9P0N5 145 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 TCF19Q9Y242 345 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 STARD10Q9Y365 291 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 HSPG2P98160 4391 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 LY86O95711 162 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 DUX4L4P0CJ87 422 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
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USP11-208ENST00000480104 PGS1Q32NB8 556 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 OR2T2Q6IF00 324 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 HCP5Q6MZN7 132 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 FRMD7Q6ZUT3 714 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 OR8G5Q8NG78 346 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 OR52P1PQ8NH57 321 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 NABP1Q96AH0 204 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 FIS1Q9Y3D6 152 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 FAT2Q9NYQ8 4349 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 A6NDX4 124 aa9.5□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 NDUFA2O43678 99 aa9.5□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 SLC22A3O75751 556 aa9.5□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 ADORA3P0DMS8 318 aa9.5□□□□□ -0.89
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USP11-208ENST00000480104 CLRN1P58418 232 aa9.5□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 MPPED2Q15777 294 aa9.5□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 RNF220Q5VTB9 566 aa9.5□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa9.5□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 OR4F3Q6IEY1 312 aa9.5□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 FAM90A1Q86YD7 464 aa9.5□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 RIMKLAQ8IXN7 391 aa9.5□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 C10orf111Q8N326 155 aa9.5□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
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USP11-208ENST00000480104 LYZL4Q96KX0 146 aa9.5□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 P2RX4Q99571 388 aa9.5□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 ECSITQ9BQ95 431 aa9.5□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 C1orf50Q9BV19 199 aa9.5□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 SPATA9Q9BWV2 254 aa9.5□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 KCNK9Q9NPC2 374 aa9.5□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa9.5□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa9.5□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 CAPN7Q9Y6W3 813 aa9.5□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa9.49□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 A0A1B0GWA3 101 aa9.49□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 OOEPA6NGQ2 149 aa9.49□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 H3BQF6 201 aa9.49□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 IGHG1P01857 330 aa9.49□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 HLA-DPB1P04440 258 aa9.49□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 SERPINE1P05121 402 aa9.49□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 NR2F1P10589 423 aa9.49□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 RAC2P15153 192 aa9.49□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 TUBG1P23258 451 aa9.49□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 RAB13P51153 203 aa9.49□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 RAD23AP54725 363 aa9.49□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 POU4F2Q12837 409 aa9.49□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 MAB21L1Q13394 359 aa9.49□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 SGCAQ16586 387 aa9.49□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 HIST3H3Q16695 136 aa9.49□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 NXNQ6DKJ4 435 aa9.49□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 C18orf65Q6ZTR6 163 aa9.49□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 C8orf86Q6ZUL3 223 aa9.49□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 ANKRD46Q86W74 232 aa9.49□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa9.49□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 C10orf53Q8N6V4 93 aa9.49□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 NOXO1Q8NFA2 376 aa9.49□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 C12orf10Q9HB07 376 aa9.49□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 TUBG2Q9NRH3 451 aa9.49□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 RNF7Q9UBF6 113 aa9.49□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
USP11-208ENST00000480104 SORL1Q92673 2214 aa9.48□□□□□ -0.89
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