RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 C1orf146Q5VVC0 180 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 SLC27A4Q6P1M0 643 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 UGT2A3Q6UWM9 527 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 HIST2H3AQ71DI3 136 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 SDR9C7Q8NEX9 313 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 OR1F12Q8NHA8 337 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 ABHD4Q8TB40 342 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 UBASH3BQ8TF42 649 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 TSSK2Q96PF2 358 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 DIRC2Q96SL1 478 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 COQ7Q99807 217 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 SYT3Q9BQG1 590 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 ARMC1Q9NVT9 282 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 VNN3Q9NY84 501 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 DCTN6O00399 190 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 HMGN1P05114 100 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 OSMP13725 252 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 USF1P22415 310 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 FMO3P31513 532 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 GRK5P34947 590 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 WNT5AP41221 380 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 SLC25A1P53007 311 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 PPP1CBP62140 327 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 ELFN2Q5R3F8 820 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 CCDC121Q6ZUS5 278 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 ZNF101Q8IZC7 436 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 ICA1LQ8NDH6 482 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 PROKR2Q8NFJ6 384 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 DDOQ99489 341 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 CMC2Q9NRP2 79 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 TAAR3PQ9P1P4 343 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 ENOPH1Q9UHY7 261 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 DNHD1Q96M86 4753 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 CSPG4Q6UVK1 2322 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 TLN2Q9Y4G6 2542 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 RTTNQ86VV8 2226 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 C17orf100A8MU93 164 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 VWC2LB2RUY7 222 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 EBAG9O00559 213 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 RER1O15258 196 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 MPZL1O95297 269 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 SOX14O95416 240 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 FASP25445 335 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 NR4A2P43354 598 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 HIPK1Q86Z02 1210 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 ATG16L2Q8NAA4 619 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 SLC37A3Q8NCC5 494 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 OR8D4Q8NGM9 314 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 RDH5Q92781 318 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 OSBPL10Q9BXB5 764 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 PRRG3Q9BZD7 231 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 OR51B6Q9H340 312 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 KIF17Q9P2E2 1029 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 AP4S1Q9Y587 144 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 LHFPL6Q9Y693 200 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 CR1P17927 2039 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 TFP02787 698 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 ADH4P08319 380 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 ACHEP22303 614 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 ALDH3B1P43353 468 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 TMEM33P57088 247 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 PPP2R2BQ00005 443 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 MSMPQ1L6U9 139 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 TEX30Q5JUR7 227 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 SLC18B1Q6NT16 456 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 RHOUQ7L0Q8 258 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 LRP11Q86VZ4 500 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 PARP8Q8N3A8 854 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 OR5K1Q8NHB7 308 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 SLC25A40Q8TBP6 338 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 PTP4A1Q93096 173 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 FOXN4Q96NZ1 517 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 PITX2Q99697 317 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 ATF6BQ99941 703 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 OR2J1Q9GZK6 312 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 EGLN1Q9GZT9 426 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 CHODLQ9H9P2 273 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 DECR2Q9NUI1 292 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 FZR1Q9UM11 496 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 HIVEP2P31629 2446 aa11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms