RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467594.1

NISCH-205, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 1,014 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-205ENST00000467594 ARHGAP24Q8N264 748 aa13.14□□□□□ -0.31
NISCH-205ENST00000467594 OR51F2Q8NH61 342 aa13.14□□□□□ -0.31
NISCH-205ENST00000467594 OR1F12Q8NHA8 337 aa13.14□□□□□ -0.31
NISCH-205ENST00000467594 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa13.14□□□□□ -0.31
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NISCH-205ENST00000467594 TMEM186Q96B77 213 aa13.14□□□□□ -0.31
NISCH-205ENST00000467594 RAB39BQ96DA2 213 aa13.14□□□□□ -0.31
NISCH-205ENST00000467594 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
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NISCH-205ENST00000467594 TNFSF4P23510 183 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-205ENST00000467594 CDK5R2Q13319 367 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-205ENST00000467594 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
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NISCH-205ENST00000467594 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
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NISCH-205ENST00000467594 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP13.12□□□□□ -0.319e-9■■■■■ 26.8
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NISCH-205ENST00000467594 RER1O15258 196 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-205ENST00000467594 UBOX5O94941 541 aa13.11□□□□□ -0.31
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NISCH-205ENST00000467594 AVPI1Q5T686 147 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-205ENST00000467594 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa13.11□□□□□ -0.31
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NISCH-205ENST00000467594 HIST2H3AQ71DI3 136 aa13.11□□□□□ -0.31
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NISCH-205ENST00000467594 COX10Q12887 443 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-205ENST00000467594 SCGB2A2Q13296 93 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-205ENST00000467594 PGBD2Q6P3X8 592 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-205ENST00000467594 CYP2R1Q6VVX0 501 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-205ENST00000467594 RINLQ6ZS11 566 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-205ENST00000467594 ZBTB46Q86UZ6 589 aa13.1□□□□□ -0.31
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