RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465576.1

CLRN1-AS1-201, CLRN1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CLRN1-AS1, Length 2,045 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa5.64□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MALT1Q9UDY8 824 aa5.64□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa5.64□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SLC5A6Q9Y289 635 aa5.64□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 LRP12Q9Y561 859 aa5.64□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa5.63□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa5.63□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 AIREO43918 545 aa5.63□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TNFSF13O75888 250 aa5.63□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ABHD16AO95870 558 aa5.63□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MPGP29372 298 aa5.63□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TIMP3P35625 211 aa5.63□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CAPZA2P47755 286 aa5.63□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RPS25P62851 125 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 BDH1Q02338 343 aa5.63□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ROM1Q03395 351 aa5.63□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ACSM1Q08AH1 577 aa5.63□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PMPCAQ10713 525 aa5.63□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 AQP6Q13520 282 aa5.63□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TPBGQ13641 420 aa5.63□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ODF4Q2M2E3 257 aa5.63□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 FAM27BQ5VT28 67 aa5.63□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa5.63□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SLC16A14Q7RTX9 510 aa5.63□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 BTLAQ7Z6A9 289 aa5.63□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa5.63□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SKA3Q8IX90 412 aa5.63□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GJC3Q8NFK1 279 aa5.63□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RAB2BQ8WUD1 216 aa5.63□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RNF133Q8WVZ7 376 aa5.63□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 HSD17B8Q92506 261 aa5.63□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa5.63□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 KCNN2Q9H2S1 579 aa5.63□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 BRD7Q9NPI1 651 aa5.63□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PLEK2Q9NYT0 353 aa5.63□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ENPP5Q9UJA9 477 aa5.63□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 FBXL3Q9UKT7 428 aa5.63□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZNF835Q9Y2P0 537 aa5.63□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PCNX1Q96RV3 2341 aa5.63□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZNF878C9JN71 531 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 H3BMQ9 156 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 LYZL6O75951 148 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 IL18BPO95998 194 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ITGA5P08648 1049 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CST2P09228 141 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GLI4P10075 376 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZNF32P17041 273 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 HSD11B1P28845 292 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GABRA5P31644 462 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 OPRL1P41146 370 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TMBIM6P55061 237 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 VBP1P61758 197 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GALK2Q01415 458 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CDK5R1Q15078 307 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 Q6ZT83 130 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZNF610Q8N9Z0 462 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 OR10S1Q8NGN2 331 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GHSRQ92847 366 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 STARD4Q96DR4 205 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 HDHD5Q9BXW7 423 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RNF121Q9H920 327 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PROCRQ9UNN8 238 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SHANK1Q9Y566 2161 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RELNP78509 3460 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 EPG5Q9HCE0 2579 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 POLEQ07864 2286 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MYO7BQ6PIF6 2116 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CIB4A0PJX0 185 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 H3BSH0 61 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 OGG1O15527 345 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SGCEO43556 437 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PLPP2O43688 288 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 DOK2O60496 412 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZNF254O75437 659 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RAD51DO75771 328 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GABARAPO95166 117 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 HLA-HP01893 362 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CRHP06850 196 aa5.62□□□□□ -1.51
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CD79AP11912 226 aa5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms