RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458961.1

SNORD109B-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 109B, humanhuman

BASIC

Gene SNORD109B, Length 67 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleolus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD109B-201ENST00000458961 SFTPBP07988 381 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 WNT2P09544 360 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 TSPAN19P0C672 248 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 COX5BP10606 129 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 NR2C1P13056 603 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 IRF2P14316 349 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 SELEP16581 610 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 KITLGP21583 273 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 FUT4P22083 530 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 RPL4P36578 427 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 PMELP40967 661 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 RBM34P42696 430 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 GPR4P46093 362 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 PITPNBP48739 271 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 CENPAP49450 140 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 SRP9P49458 86 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 GZMMP51124 257 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 PRSS12P56730 875 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 KRTAP10-3P60369 221 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 RAP1BP61224 184 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 FGF12P61328 243 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 RAP1AP62834 184 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 GUCY1A3Q02108 690 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 SCRN3Q0VDG4 424 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 TUSC1Q2TAM9 212 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 CYBRD1Q53TN4 286 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 TTMPQ5BVD1 217 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 RABL3Q5HYI8 236 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 AGBL2Q5U5Z8 902 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 GPR157Q5UAW9 335 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 FAM205BPQ63HN1 556 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 OLFML2AQ68BL7 652 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 SLC27A4Q6P1M0 643 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 LYPD2Q6UXB3 125 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 LRRN1Q6UXK5 716 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 CCDC80Q76M96 950 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 SYT9Q86SS6 491 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 OAFQ86UD1 273 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 C1QL4Q86Z23 238 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 NRMQ8IXM6 262 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 PDZD9Q8IXQ8 264 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 C1orf174Q8IYL3 243 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 DPP10Q8N608 796 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 FITM2Q8N6M3 262 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 POU5F2Q8N7G0 328 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 LRRC75AQ8NAA5 344 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 NPEPL1Q8NDH3 523 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 BHLHE23Q8NDY6 225 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 OR8B3Q8NGG8 313 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 OR5L1Q8NGL2 311 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 OR13C2Q8NGS9 318 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 OR13G1Q8NGZ3 307 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 OR4F5Q8NH21 305 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 OR1F12Q8NHA8 337 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 RASSF5Q8WWW0 418 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 WFDC12Q8WWY7 111 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 RAB40AQ8WXH6 277 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 UBE2FQ969M7 185 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 UPRTQ96BW1 309 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 RASD2Q96D21 266 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 HAVCR1Q96D42 359 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 BPIFA2Q96DR5 249 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 TPD52L3Q96J77 140 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 PLEKHA8Q96JA3 519 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 MEGF10Q96KG7 1140 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 PRRC1Q96M27 445 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 Q96M85 177 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 ZNF570Q96NI8 536 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 TECTBQ96PL2 329 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 OR8B2Q96RD0 313 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 PKP2Q99959 881 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 ECSITQ9BQ95 431 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 TMEM246Q9BRR3 403 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 PCGF1Q9BSM1 259 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 FNDC11Q9BVV2 318 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 CDADC1Q9BWV3 514 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 CHIAQ9BZP6 476 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 SLITRK2Q9H156 845 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 RABEP2Q9H5N1 569 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 WDR76Q9H967 626 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 SMURF2Q9HAU4 748 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 BEX1Q9HBH7 125 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 TMEM165Q9HC07 324 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 GCM1Q9NP62 436 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 UFSP2Q9NUQ7 469 aa2.27□□□□□ -2.05
SNORD109B-201ENST00000458961 TBCCD1Q9NVR7 557 aa2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms