RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428858.1

TTC28-AS1-209, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 565 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-209ENST00000428858 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ATPIF1Q9UII2 106 aa7.1□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BOLA1Q9Y3E2 137 aa7.1□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LHFPL6Q9Y693 200 aa7.1□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa7.1□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MED12LQ86YW9 2145 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR6C6A6NF89 314 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SNTNA6NMZ2 147 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RER1O15258 196 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ICMTO60725 284 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ENTPD6O75354 484 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CLIC3O95833 236 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PTHP01270 115 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CECR9P0C854 216 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PATE4P0C8F1 98 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 COX5BP10606 129 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PSKH1P11801 424 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF823P16415 610 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF83P51522 516 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ISL1P61371 349 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RPS7P62081 194 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PLP2Q04941 152 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BSPH1Q075Z2 132 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 APOFQ13790 326 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RAB35Q15286 201 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KLHL12Q53G59 568 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OTPQ5XKR4 325 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LYPD4Q6UWN0 246 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC16A9Q7RTY1 509 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF454Q8N9F8 522 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GJC3Q8NFK1 279 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IL17RDQ8NFM7 739 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ST7LQ8TDW4 575 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 APH1BQ8WW43 257 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CYGBQ8WWM9 190 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PLPPR2Q96GM1 343 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RADILQ96JH8 1075 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 Q96MT0 163 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CDADC1Q9BWV3 514 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ANKRD60Q9BZ19 345 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HDHD2Q9H0R4 259 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RNF121Q9H920 327 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RASSF1Q9NS23 344 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 POLR1DQ9Y2S0 133 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-209ENST00000428858 M0R1B8 84 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RGS13O14921 159 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SGCEO43556 437 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SYNGR3O43761 229 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DOK2O60496 412 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SELENOFO60613 162 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TMCC2O75069 709 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-209ENST00000428858 WBP4O75554 376 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CTAG2O75638 210 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CRYAAP02489 173 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CD3EP07766 207 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CELA3BP08861 270 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GNAO1P09471 354 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SPARCP09486 303 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF35P13682 527 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-209ENST00000428858 STOMP27105 288 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SSTR2P30874 369 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IL5RAQ01344 420 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NAAAQ02083 359 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-209ENST00000428858 POU4F2Q12837 409 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ECH1Q13011 328 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RAB39AQ14964 217 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MOGQ16653 247 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ELFN2Q5R3F8 820 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C6orf52Q5T4I8 152 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ALKBH2Q6NS38 261 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ADAM5Q6NVV9 412 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF774Q6NX45 483 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-209ENST00000428858 B3GLCTQ6Y288 498 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CFAP77Q6ZQR2 320 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DCDC5Q6ZRR9 648 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RHOUQ7L0Q8 258 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SHFQ7M4L6 423 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SATL1Q86VE3 508 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LINC00346Q8IVM7 164 aa7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms