RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 DEGS2Q6QHC5 323 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 RHOUQ7L0Q8 258 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 RRM2BQ7LG56 351 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM229BQ8NBD8 167 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM185AQ8NFB2 350 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OR13H1Q8NG92 308 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OR4S1Q8NGB4 309 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OR6S1Q8NH40 331 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 NRIP2Q9BQI9 281 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM27Q9HBJ8 222 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 IFT46Q9NQC8 304 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 KLHL1Q9NR64 748 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TCFL5Q9UL49 500 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 STARD10Q9Y365 291 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 B3GALT2O43825 422 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 AGAP20933 346 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SOX2P48431 317 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PGDP52209 483 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRN1Q6UXK5 716 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC16A14Q7RTX9 510 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TMPRSS12Q86WS5 348 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CBLN2Q8IUK8 224 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF304Q9HCX3 659 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 THADAQ6YHU6 1953 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PRSS37A4D1T9 235 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 GRXCR1A8MXD5 290 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 APBB3O95704 486 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 FCER2P06734 321 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 FBXO45P0C2W1 286 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 MAOAP21397 527 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 EDNRAP25101 427 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 AVPR2P30518 371 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SORDQ00796 357 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 NNATQ16517 81 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 WBP2NLQ6ICG8 309 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 LURAP1LQ8IV03 231 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 WNT2BQ93097 391 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 STARD5Q9NSY2 213 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PISDQ9UG56 409 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRC72A6NJI9 287 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TERTO14746 1132 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 IFNA16P05015 189 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PMELP40967 661 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ATP1B3P54709 279 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PCGF3Q3KNV8 242 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 C5orf34Q96MH7 638 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SRMSQ9H3Y6 488 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1W2PP11 408 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ABOP16442 354 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PTGDSP41222 190 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 VAX1Q5SQQ9 334 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 C11orf87Q6NUJ2 197 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PMEPA1Q969W9 287 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TXNIPQ9H3M7 391 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 LRP12Q9Y561 859 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A0J9YY10 115 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OR2F2O95006 317 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 MPZL1O95297 269 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 FOLR2P14207 255 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OR2F1Q13607 317 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OGFOD3Q6PK18 319 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC35D2Q76EJ3 337 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OR51F2Q8NH61 342 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OR5AK2Q8NH90 309 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ROBO4Q8WZ75 1007 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TSLPQ969D9 159 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ARL5BQ96KC2 179 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 NUDT9Q9BW91 350 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PDE7BQ9NP56 450 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 LHFPL6Q9Y693 200 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 DNAJC13O75165 2243 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TRAV18A0A075B6X5 111 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PQLC2LA1A4F0 135 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 RAB19A4D1S5 217 aa3.22□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms