RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419253.1

TTC28-AS1-203, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 846 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FN3KQ9H479 309 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TUBG2Q9NRH3 451 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CYSLTR2Q9NS75 346 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DECR2Q9NUI1 292 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TBCCD1Q9NVR7 557 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-203ENST00000419253 VNN3Q9NY84 501 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KIF17Q9P2E2 1029 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DNAJB9Q9UBS3 223 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HIVEP2P31629 2446 aa10.65□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZFHX3Q15911 3703 aa10.65□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TLN2Q9Y4G6 2542 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CR1P17927 2039 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C17orf100A8MU93 164 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DCTN6O00399 190 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 BHLHE40O14503 412 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RER1O15258 196 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GPANK1O95872 356 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IGHV3-13P01766 116 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GAAP10253 952 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF3P17036 446 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 POU1F1P28069 291 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RGS6P49758 472 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MEP1BQ16820 701 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZMAT1Q5H9K5 638 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ELFN2Q5R3F8 820 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C1orf146Q5VVC0 180 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OTPQ5XKR4 325 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LNX2Q8N448 690 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ATG16L2Q8NAA4 619 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CYB561A3Q8NBI2 242 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SLC26A10Q8NG04 563 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RDH5Q92781 318 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OTULINQ96BN8 352 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PITX2Q99697 317 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 YAE1D1Q9NRH1 226 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ARMC1Q9NVT9 282 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ATPIF1Q9UII2 106 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KCNG2Q9UJ96 466 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ABCA1O95477 2261 aa10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CD5LO43866 347 aa10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NGFP01138 241 aa10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ANXA8P13928 327 aa10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PAICSP22234 425 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FMO3P31513 532 aa10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PYCR1P32322 319 aa10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF81P51508 661 aa10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 BLVRAP53004 296 aa10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ECH1Q13011 328 aa10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TMEM249Q2WGJ8 235 aa10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CYB5R2Q6BCY4 276 aa10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SLC27A4Q6P1M0 643 aa10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CORO6Q6QEF8 472 aa10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CD300LDQ6UXZ3 194 aa10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LINC00346Q8IVM7 164 aa10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SLC37A3Q8NCC5 494 aa10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR8D4Q8NGM9 314 aa10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 COQ7Q99807 217 aa10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 BPESC1Q9GZL8 116 aa10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 EGLN1Q9GZT9 426 aa10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CHODLQ9H9P2 273 aa10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LHFPL6Q9Y693 200 aa10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZANQ9Y493 2812 aa10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 J3QW42 95 aa10.62□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SPRY3O43610 288 aa10.62□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ICMTO60725 284 aa10.62□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TFP02787 698 aa10.62□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ACHEP22303 614 aa10.62□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TNFSF4P23510 183 aa10.62□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GRK5P34947 590 aa10.62□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GZMKP49863 264 aa10.62□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CHN2P52757 468 aa10.62□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CCL8P80075 99 aa10.62□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CRMP1Q14194 572 aa10.62□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TAF13Q15543 124 aa10.62□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TSTQ16762 297 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CCDC121Q6ZUS5 278 aa10.62□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR51L1Q8NGJ5 315 aa10.62□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa10.62□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR6K6Q8NGW6 343 aa10.62□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR4Q3Q8NH05 313 aa10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.4 ms