RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415172.1

VPS13A-AS1-201, VPS13A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A-AS1, Length 519 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR6C6A6NF89 314 aa14.93□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TVP23AA6NH52 213 aa14.93□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM183AA6NL82 134 aa14.93□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 H3BNX3 289 aa14.93□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SURF4O15260 269 aa14.93□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SYNGR3O43761 229 aa14.93□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SSX4O60224 188 aa14.93□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ICMTO60725 284 aa14.93□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CLUP10909 449 aa14.93□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CD99P14209 185 aa14.93□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GGT2P36268 569 aa14.93□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 WNT5AP41221 380 aa14.93□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EFNA4P52798 201 aa14.93□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MSMPQ1L6U9 139 aa14.93□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CLEC12BQ2HXU8 276 aa14.93□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ELFN2Q5R3F8 820 aa14.93□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC18B1Q6NT16 456 aa14.93□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CORO6Q6QEF8 472 aa14.93□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LINC00346Q8IVM7 164 aa14.93□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF101Q8IZC7 436 aa14.93□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SYNPRQ8TBG9 265 aa14.93□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DOK1Q99704 481 aa14.93□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 COQ7Q99807 217 aa14.93□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRRG3Q9BZD7 231 aa14.93□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa14.93□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa14.93□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM129A0AVI4 362 aa14.92□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SAC3D1A6NKF1 404 aa14.92□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 M0R233 179 aa14.92□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IGFBP5P24593 272 aa14.92□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ERVS71-1P61550 626 aa14.92□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HIST1H3AP68431 136 aa14.92□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa14.92□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM236Q5W0B7 351 aa14.92□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KDM4DQ6B0I6 523 aa14.92□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CFAP77Q6ZQR2 320 aa14.92□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa14.92□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HIST2H3AQ71DI3 136 aa14.92□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNRF4Q8WWF5 429 aa14.92□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SORCS2Q96PQ0 1159 aa14.92□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PITX2Q99697 317 aa14.92□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PKP2Q99959 881 aa14.92□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OSBPL10Q9BXB5 764 aa14.92□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RAB1BQ9H0U4 201 aa14.92□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GPR160Q9UJ42 338 aa14.92□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MITFO75030 526 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SPARCP09486 303 aa14.91□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF250P15622 560 aa14.91□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GCH1P30793 250 aa14.91□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ENTPD1P49961 510 aa14.91□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PPP1CBP62140 327 aa14.91□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ECH1Q13011 328 aa14.91□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NKPD1Q17RQ9 610 aa14.91□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SPATA46Q5T0L3 261 aa14.91□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLBD1Q6P4A8 553 aa14.91□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM154Q6P9G4 183 aa14.91□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LYPD4Q6UWN0 246 aa14.91□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LRP11Q86VZ4 500 aa14.91□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF511Q8NB15 262 aa14.91□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC7A6Q92536 515 aa14.91□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CIB1Q99828 191 aa14.91□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ATF6BQ99941 703 aa14.91□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HCAR1Q9BXC0 346 aa14.91□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR51V1Q9H2C8 321 aa14.91□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MS4A5Q9H3V2 200 aa14.91□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MED20Q9H944 212 aa14.91□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 WDR76Q9H967 626 aa14.91□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TBCCD1Q9NVR7 557 aa14.91□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa14.91□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TVP23BQ9NYZ1 205 aa14.91□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa14.91□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa14.9□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 H3BSA7 217 aa14.9□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRODHO43272 600 aa14.9□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GLCEO94923 617 aa14.9□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 F12P00748 615 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADRA2AP08913 450 aa14.9□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ALDH3B1P43353 468 aa14.9□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RGS6P49758 472 aa14.9□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PPP2R2BQ00005 443 aa14.9□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SNAPC1Q16533 368 aa14.9□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MOGQ16653 247 aa14.9□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF718Q3SXZ3 478 aa14.9□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LINC01590Q5TEZ4 76 aa14.9□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CLEC2AQ6UVW9 174 aa14.9□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC25A40Q8TBP6 338 aa14.9□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SNX33Q8WV41 574 aa14.9□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 STMN2Q93045 179 aa14.9□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PTP4A1Q93096 173 aa14.9□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 COG8Q96MW5 612 aa14.9□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR2J1Q9GZK6 312 aa14.9□□□□□ -0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 S100A14Q9HCY8 104 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms